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Enregistrement W2276842898 · doi:10.1161/circ.126.suppl_21.a19764

Abstract 19764: Cardiac Disease Modeling of Familial Left Ventricular Noncompaction Cardiomyopathy Using Induced Pluripotent Stem Cells

2012· article· en· W2276842898 sur OpenAlexaff
Yen Bui, Kimberly R. Cordes, Samantha Hastie, Deepak Srivastava

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensKimberly-Clark (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCardiomyopathyInduced pluripotent stem cellCardiologyLeft ventricular noncompactionDiseaseInternal medicineStem cellHeart failureEmbryonic stem cellGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Left ventricular noncompaction cardiomyopathy (LVNC) is thought to arise from developmental arrest of the normal compaction of ventricular heart muscle, sometime between weeks 4-8 of gestation. In normal heart development, a network of muscle bands (trabeculations) compact fully, resulting in a dense muscle and a smooth inner surface. Failure of trabecular compaction results in a muscle wall consisting of a spongy myocardium with a meshwork of trabeculations that can lead to thin dilated heart muscle and impaired muscle function. Although several disease-causing genes have been implicated in LVNC, the genetic cause remains unknown in more than 50% of patients. We hypothesize that LVNC arises from developmental arrest of the embryonic ventricular myocardial compaction process and that LVNC patients will have expression profiles reflective of this. We have identified a family with LVNC affecting 4 individuals. Through whole exome sequencing we identified a mutation in a cardiac developmental gene that was associated with the LVNC phenotype and was fully penetrant in this family. Using dermal fibroblasts from members of this family, we generated induced pluripotent stem (iPS) cells from affected and unaffected family members to identify transcriptome and functional consequences in cardiomyocytes harboring the genetic mutation. We will present our results from this genetic and cellular approach to LVNC, which allows study of the physiologic consequences of genetic mutations in relevant human cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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