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Enregistrement W2280121081 · doi:10.18632/oncotarget.6983

Prostate extracellular vesicles in patient plasma as a liquid biopsy platform for prostate cancer using nanoscale flow cytometry

2016· article· en· W2280121081 sur OpenAlexafffundabout
Colleen N. Biggs, Khurram Siddiqui, Ali A. Al‐Zahrani, Siddika Pardhan, Sabine Brett, Qiuquan Guo, Jun Yang, Philipp Wolf, Nicholas Power, Paul N. Durfee, Connor D. MacMillan, Jason L. Townson, Jeffrey Brinker, Neil Fleshner, Jonathan I. Izawa, Ann F. Chambers, Joseph L. Chin, Hon S. Leong

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of TorontoLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesProstate Cancer CanadaLawson Health Research InstituteMovember FoundationSanofi
Mots-clésProstate cancerMedicineLiquid biopsyExtracellular vesiclesProstateCancerUrologyFlow cytometryInternal medicineImmunologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Colleen N. Biggs 1,3,* , Khurram M. Siddiqui 1,3,* , Ali A. Al-Zahrani 1,3,7 , Siddika Pardhan 1,3 , Sabine I. Brett 1,3 , Qiu Q. Guo 8 , Jun Yang 8 , Philipp Wolf 6 , Nicholas E. Power 1,2,3 , Paul N. Durfee 5 , Connor D. MacMillan 1,3 , Jason L. Townson 5 , Jeffrey C. Brinker 5 , Neil E. Fleshner 4 , Jonathan I. Izawa 1,2,3 , Ann F. Chambers 2 , Joseph L. Chin 1,2,3 and Hon S. Leong 1,3 1 Department of Surgery, Western University, London, Canada 2 Department of Oncology, Western University, London, Canada 3 Translational Prostate Cancer Research Laboratory, Lawson Health Research Institute, London, Canada 4 University Health Network, University of Toronto, Toronto, Canada 5 Sandia National Laboratories, Albuquerque, NM, USA 6 Department of Urology, University Medical Center Freiburg, Freiburg, Germany 7 Department of Urology, University of Dammam, Dammam, Saudi Arabia 8 Department of Mechanical and Materials Engineering, Western University, London, Canada * These authors have contributed equally to this work Correspondence to: Hon S. Leong, email: // Keywords : prostate microparticles, extracellular vesicles, nanoscale flow cytometry, prostate cancer, liquid biopsy Received : December 28, 2015 Accepted : January 16, 2016 Published : January 22, 2016 Abstract Background: Extracellular vesicles released by prostate cancer present in seminal fluid, urine, and blood may represent a non-invasive means to identify and prioritize patients with intermediate risk and high risk of prostate cancer. We hypothesize that enumeration of circulating prostate microparticles (PMPs), a type of extracellular vesicle (EV), can identify patients with Gleason Score≥4+4 prostate cancer (PCa) in a manner independent of PSA. Patients and Methods: Plasmas from healthy volunteers, benign prostatic hyperplasia patients, and PCa patients with various Gleason score patterns were analyzed for PMPs. We used nanoscale flow cytometry to enumerate PMPs which were defined as submicron events (100-1000nm) immunoreactive to anti-PSMA mAb when compared to isotype control labeled samples. Levels of PMPs (counts/µL of plasma) were also compared to CellSearch CTC Subclasses in various PCa metastatic disease subtypes (treatment naïve, castration resistant prostate cancer) and in serially collected plasma sets from patients undergoing radical prostatectomy. Results: PMP levels in plasma as enumerated by nanoscale flow cytometry are effective in distinguishing PCa patients with Gleason Score≥8 disease, a high-risk prognostic factor, from patients with Gleason Score≤7 PCa, which carries an intermediate risk of PCa recurrence. PMP levels were independent of PSA and significantly decreased after surgical resection of the prostate, demonstrating its prognostic potential for clinical follow-up. CTC subclasses did not decrease after prostatectomy and were not effective in distinguishing localized PCa patients from metastatic PCa patients. Conclusions: PMP enumeration was able to identify patients with Gleason Score ≥8 PCa but not patients with Gleason Score 4+3 PCa, but offers greater confidence than CTC counts in identifying patients with metastatic prostate cancer. CTC Subclass analysis was also not effective for post-prostatectomy follow up and for distinguishing metastatic PCa and localized PCa patients. Nanoscale flow cytometry of PMPs presents an emerging biomarker platform for various stages of prostate cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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