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Enregistrement W2281819587 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.863.7

Identification CD79a and CD79b homologs in channel catfish, Ictaulurus punctatus

2008· article· en· W2281819587 sur OpenAlexaff
Manoranjan Sahoo, Eva‐Stina Edholm, James L. Stafford, Eva Bengtén, Norman W. Miller, Melanie Wilson

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésCatfishBiologyMolecular biologyImmunoglobulin domainTransmembrane domainTransmembrane proteinImmunoreceptor tyrosine-based activation motifEpitopeAntibodyGeneTransfectionImmunoprecipitationSignal peptideCell biologyTyrosine kinaseReceptorPeptide sequenceSignal transductionGeneticsSH2 domain

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The catfish (Ip) B cell receptor accessory molecules CD79a and CD79b homologs have been identified. Each are encoded by single copy genes that encode proteins containing a signal peptide, an extracellular immunoglobulin domain, a transmembrane region and a cytoplasmic tail containing an immunoreceptor tyrosine kinase activation motif (ITAM). At the message level, both IpCD79a and IpCD79b correlate well with IgM message expression since they are highly expressed in membrane IgM + peripheral blood leukocytes (PBL) and in catfish clonal B cell lines, but not in IgM − PBL or in clonal T cells or macrophages. Such findings indicate that IpCD79a and IpCD79b expression is B cell restricted. Furthermore, studies using catfish clonal B cells (3B11) transfected with constructs encoding epitope‐tagged IpCD79 proteins revealed that IpCD79a is expressed as a 45 kDa protein and IpCD79b is expressed as a 32 kDa protein. These correlate with the molecular weights of putative tyrosine phosphorylated accessory proteins that are co‐immunoprecipitated with surface IgM following anti‐Ig stimulation. Supported by NIH grant R01 AI19530 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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