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Enregistrement W2281923713 · doi:10.1139/cjps-2015-0164

Molecular cloning and expression of a jasmonate biosynthetic gene allene oxide cyclase from <i>Camellia sinensis</i>

2016· article· en· W2281923713 sur OpenAlexvenueno aff
Mengxin Wang, Qingping Ma, Baoyu Han, Xinghui Li

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMethyl jasmonateJasmonic acidBiologyJasmonateCamellia sinensisOpen reading frameComplementary DNAGenePlant defense against herbivoryAmino acidBiochemistryMolecular biologyPeptide sequenceBotanyArabidopsis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As a family of signaling plant hormone, jasmonic acid plays an important role in coordinating plant defense responses to pests and pathogen attack through transcriptional and metabolic changes. In the jasmonate biosynthetic pathway of plants, allene oxide cyclase (AOC) is an essential enzyme. Here we cloned a cDNA from tea plant (Camellia sinensis), named as CsAOC (GenBank: HQ889679), which was 916 bp, containing an open reading frame (738 bp) encoding 245 amino acids. Comparative and bioinformatic analyses revealed that the deduced protein of CsAOC was highly homologous to AOC from other plant species. Phylogenetic analysis indicated that CsAOC was clustered in a closely related subgroup with AOC of Ipomoea nil. The full-length coding region of CsAOC was ligated with pET-32a and successfully expressed in E. coli BL21 (DE3), and purified. Real-time quantitative PCR analysis revealed that methyl jasmonate (MeJA) treatment on its own potently enhanced its expression over the control (healthy leaves), suggesting feedback activation of CsAOC. The expression under salicylic acid (SA) and wounding treatments was up-regulated. The mRNA expression of CsAOC could be induced by tea geometrids and tea green leafhoppers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,977

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,174
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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