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Enregistrement W2282899861 · doi:10.1096/fasebj.25.1_supplement.967.7

Characterization of Plasmodium falciparum Holo‐ACP Synthase: a Potential Antimalarial Drug Target

2011· article· en· W2282899861 sur OpenAlexafffund
Germaine Tami, Peter Murphy, David M. Byers

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésApicoplastPlasmodium falciparumAcyl carrier proteinEnzymeBiologyBiochemistryCoenzyme ASignal peptideATP synthasePeptide sequenceBiosynthesisMalariaApicomplexaGeneReductase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The protozoan parasite Plasmodium falciparum is responsible for the most lethal form of malaria and kills about one million people annually, most of whom are children in sub‐Saharan Africa. Fatty acid synthesis (FAS) is a validated antimalarial strategy: it occurs in a specialized parasite organelle (the apicoplast) and uses a dissociated type II FAS system similar to bacteria. Bioinformatics analysis indicates that P. falciparum encodes a single enzyme, holo‐ACP synthase ( Pf AcpS), responsible for activating acyl carrier protein (ACP) involved in FAS. Pf AcpS consists of a signal/leader peptide, a large N‐terminal domain of unknown function, and a C‐terminal domain (PfAcpS‐C) that is highly homologous (30–50% similarity) to trimeric bacterial AcpS enzymes. We have expressed and isolated the soluble Pf AcpS‐C domain and shown that it catalyzes the transfer of (acyl)phosphopantetheine to Pf ACP from coenzyme A or from its derivatives acetyl‐CoA and octanoyl CoA. Pf AcpS exhibited much lower activity than E. coli AcpS and preferred higher concentrations of CoA derivatives. Several novel inhibitors of E. coli AcpS also blocked Pf AcpS activity, although the degree of inhibition differed between the enzymes. The sequence similarity between Pf AcpS‐C and bacterial AcpS enzymes suggests that drugs targeting the latter might also inhibit P. falciparum growth and pathogenesis. (Supported by NSERC)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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