Degradation, Promoter Recruitment and Transactivation Mediated by the Extreme N-Terminus of MHC Class II Transactivator CIITA Isoform III
Notice bibliographique
Résumé
Multiple relationships between ubiquitin-proteasome mediated protein turnover and transcriptional activation have been well documented, but the underlying mechanisms are still poorly understood. One way to induce degradation is via ubiquitination of the N-terminal α-amino group of proteins. The major histocompatibility complex (MHC) class II transactivator CIITA is the master regulator of MHC class II gene expression and we found earlier that CIITA is a short-lived protein. Using stable and transient transfections of different CIITA constructs into HEK-293 and HeLa cell lines, we show here that the extreme N-terminal end of CIITA isoform III induces both rapid degradation and transactivation. It is essential that this sequence resides at the N-terminal end of the protein since blocking of the N-terminal end with an epitope-tag stabilizes the protein and reduces transactivation potential. The first ten amino acids of CIITA isoform III act as a portable degron and transactivation sequence when transferred as N-terminal extension to truncated CIITA constructs and are also able to destabilize a heterologous protein. The same is observed with the N-terminal ends of several known N-terminal ubiquitination substrates, such as Id2, Cdt1 and MyoD. Arginine and proline residues within the N-terminal ends contribute to rapid turnover. The N-terminal end of CIITA isoform III is responsible for efficient in vivo recruitment to the HLA-DRA promoter and increased interaction with components of the transcription machinery, such as TBP, p300, p400/Domino, the 19S ATPase S8, and the MHC-II promoter binding complex RFX. These experiments reveal a novel function of free N-terminal ends of proteins in degradation-dependent transcriptional activation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».