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Enregistrement W2284695413 · doi:10.1149/ma2015-01/39/2085

Development of Electrochemical Aptamer-Based Biosensors for the Detection of Hormonal Contaminants in Water

2015· article· en· W2284695413 sur OpenAlexaff
Gastón Contreras Jiménez, Shimaa Eissa, Andy Ng, Mohammed Zourob, Mohamed Siaj

Notice bibliographique

RevueECS Meeting Abstracts · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcGill UniversityInstitut National de la Recherche ScientifiqueUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAptamerAnalyteBiosensorChemistrySystematic evolution of ligands by exponential enrichmentDetection limitCombinatorial chemistryChromatographyBiochemistryBiologyMolecular biologyRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endocrine disrupters (EDs) are compounds that specifically interfere with the normal functions of the body’s endocrine system (system of glands for hormonal secretion) by causing adverse effects in both human and wildlife. Therefore, routine, sensitive, reliable and cost effective detection methods for EDs are highly demanded. In this work we present the selection and characterization of ssDNA aptamers that exhibit high affinity, specificity and sensitivity to progesterone (P4), 17b-estradiol (E2) and, norethisterone (NET). The aptamer selection was conducted by in vitro selections by incubating a highly diverse ssDNA library of about random 60mer sequences with the target analyte. After 15 cycles of selections, the enriched aptamers pool was cloned and sequenced. The dissociation constants (KD) of the selected aptamers determined by fluorometry and by electrochemical impedance spectroscopy (EIS) methods are in the subnanomolar order. Cross-reactivity tests for each aptamer demonstrated the high specificity to their target analyte. In addition, circular dichroism (CD) spectroscopy measurements of the selected aptamers for progesterone showed a marked conformational change upon binding the target analyte. This change in the conformation was exploited to design a biosensing platform to generate a measurable signal after binding the specific analyte by following the redox process of a couple composed for [Fe(CN)6]3-/4-. For first time, an impedimetric aptasensor for progesterone detection was developed with limit of detection of 0.90 ng/mL. We believe, based in our finding, that the continuous selection of high affinity aptamers for other EDs and their integration in a biosensing platform will facilitate the routine monitoring of EDs in environment as well as clinical and medical diagnosis purposes. Figure 1

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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