Qualitative and quantitative analysis of the genomes and chromosomes of spider monkeys (Primates: Atelidae)
Notice bibliographique
Résumé
Heterochromatin distribution and chromosomal rearrangements have been proposed as the main sources of karyotype differences among species of Neotropical primates. This variability suggests that there could be differences at other smaller-scale levels of DNA organization as well. In particular, quantitative differences between genomes result from gains and losses of individual DNA segments, and may result in varying genome sizes (C-values) among species. In this work, we studied the genomes of 23 individuals from four species in the genus Ateles (Primates: Platyrrhini): A. chamek, A. paniscus, A. belzebuth, and A. geoffroyi. We analyzed genome size and its relationship with the presence of chromosomal rearrangements and patterns of heterochromatin distribution. The C-value presented in this work for Ateles chamek is the first estimate for this species (3.09 ± 0.23 pg), whereas our estimates for A. belzebuth (2.88 ± 0.06 pg) and A. geoffroyi (3.19 ± 0.24 pg) differed from those previously published. Fluorescent in situ hybridization (FISH) and interspecies comparativegenomic hybridization (iCGH) analyses revealed that differences in genome size among species relate to localized blocks in both heterochromatic and euchromatic regions, the latter of which appear to be genetically unstable. There were also quantitative differences in Y chromosome content. It remains to be seen whether the chromosomal characteristics of Ateles here discussed are common to platyrrhine monkeys, but it is clear that these monkeys exhibit some intriguing genomic features worthy of additional exploration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».