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Enregistrement W2288250994 · doi:10.1096/fasebj.23.1_supplement.521.2

The Phospholipid Transfer Protein Sec14 is Required for Trafficking from Endosomes and Regulates Distinct trans‐Golgi Export Pathways

2009· article· en· W2288250994 sur OpenAlexafffundabout
Amy J. Curwin, Christopher R. McMaster

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEndosomeGolgi apparatusCell biologyVesicleVesicular transport proteinTransport proteinMembrane contact siteVacuolePhosphatidylinositolVesicular Transport ProteinsChemistryBiologyBiochemistryMembrane proteinCytoplasmIntegral membrane proteinMembraneSignal transductionVacuolar protein sortingEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vesicle fission, transport, and fusion are affected by membrane lipid composition. A protein known to regulate both lipid metabolism and vesicular transport is the phosphatidylcholine/phosphatidylinositol transfer protein Sec14 of Saccharomyces cerevisiae . We determined that decreasing Sec14 function affected secretion via the endosome dependent invertase route as well as the endosome independent route followed by Bgl2. Trafficking of a series of other secreted proteins including Hsp150, Cts1, Scw4, Scw10, Exg1, Cis3, and Ygp1 still occurred. Upon diminution of Sec14 function the v‐SNARE Snc1 accumulated in endosomes and the trans ‐Golgi but was competent to traffic from the Golgi to the plasma membrane. Sec14 was required for trafficking of Ste3 and the lipophilic dye FM4‐64 from the plasma membrane to the vacuole at the level of endosomes. The results from a synthetic genetic array screen for genes whose inactivation impaired growth of cells with a temperature sensitive SEC14 allele, sec14 ts , were consistent with Sec14 regulating endosome function. We go on to determine that lipid ligand occupancy by Sec14 can differentially regulate its functions. (Supported by CIHR and the Canada Research Chairs Fund)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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