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Enregistrement W2289595502 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.815.3

In Situ Measurement of Oligomerization State of NBCe1‐A in Kidney Tissues using Spatial Fluorescence Intensity Fluctuation Analysis

2010· article· en· W2289595502 sur OpenAlexaff
Mikhail Sergeev, Antoine G. Godin, L. Mark Kao, Natalia Abuladze, Paul W. Wiseman, Ira Kurtz

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryCotransporterBiophysicsMonomerIn situFluorescenceMembraneGreen fluorescent proteinCell biologyBiochemistryBiologySodiumGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NBCe1‐A plays an important role in absorbing sodium bicarbonate across the basolateral membrane of the proximal tubule. We have previously showed that minimal functional unit of NBCe1‐A is a monomer, and based on in‐vitro biochemical studies in HEK293 cells, the oligomeric state of the cotransporter was shown to be predominantly dimeric with monomeric and higher oligomeric forms also present. In the present study, we developed an in situ measurement methodology to determine the oligomeric state of NBCe1‐A without requiring tissue disruption. We used fluorescent moment image analysis and spatial intensity distribution analysis (SpIDA) to study the oligomeric state of NBCe1‐A. Both methods allow for unbiased quantitative measurement of fluorescent particle densities and oligomerization states within individual images acquired with laser‐scanning microscopy. Initially we examined basal membranes of highly adherent CHO K1 cells expressing eGFP‐tagged NBCe1‐A, and showed that NBCe1‐A existed primarily in the monomeric state and negligibly in the dimeric state on the cell membrane. We immunolabeled NBCe1‐A in kidney tissues demonstrating the NBCe1‐A is present in dimeric and rarely in higher order oligomeric states. As a control, we compared the results obtained from LSM images of tissues of NBCe1‐A knockout mouse. These experiments demonstrate for the first time the in situ oligomeric state(s) of NBCe1‐A.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,089
Score d'incertitude au seuil0,185

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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