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New loci for body fat percentage reveal link between adiposity and cardiometabolic disease risk
Yingchang Lu, Felix R. Day, Stefan Gustafsson, Martin L. Buchkovich, Jianbo Na, Véronique Bataille, Diana L. Cousminer, Zari Dastani, Alexander Drong, Tõnu Esko, David M. Evans, Mario Falchi, Mary F. Feitosa, Teresa Ferreira, Åsa K. Hedman, Robin Haring, Pirro G. Hysi, Mark M. Iles, Anne E. Justice, Stavroula Kanoni, Vasiliki Lagou, Rui Li, Xin Li, Adam E. Locke, Lu Chen, Reedik Mägi, John R. B. Perry, Tune H. Pers, Qibin Qi, Marianna Sanna, Ellen M. Schmidt, William R. Scott, Dmitry Shungin, Alexander Teumer, Anna A. E. Vinkhuyzen, Ryan W. Walker, Harm-Jan Westra, Mingfeng Zhang, Weihua Zhang, Wei Zhao, Zhihong Zhu, Uzma Afzal, Tarunveer S. Ahluwalia, Stephan J. L. Bakker, Claire Bellis, Amélie Bonnefond, Katja Borodulin, Aron S. Buchman, Tommy Cederholm, Audrey C. Choh, Hyung Jin Choi, Joanne E. Curran, C.P.G.M. de Groot, Philip L. De Jager, R.A.M. Dhonukshe-Rutten, Anke W. Enneman, Elodie Eury, Daniel S. Evans, Tom Forsén, Nele Friedrich, Frédéric Fumeron, Melissa E. Garcia, Simone Gärtner, Bok‐Ghee Han, Aki S. Havulinna, Caroline Hayward, Dena Hernández, Hans L. Hillege, Till Ittermann, Jack W. Kent, Ivana Kolčić, Tiina Laatikainen, Jari Lahti, Irene Mateo Leach, Christine G. Lee, Jong‐Young Lee, Tian Liu, Youfang Liu, Stéphane Lobbens, Marie Loh, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Carolina Medina‐Gómez, Karl Michaëlsson, Mike A. Nalls, Carrie M. Nielson, Laticia Oozageer, Laura Pascoe, Lavinia Paternoster, Ozren Polašek, Samuli Ripatti, Mark A. Sarzynski, Chan Soo Shin, Nina Smolej Narančić, Dominik Spira, Priya Srikanth, Elisabeth Steinhagen–Thiessen, Karin M. A. Swart, Leena Taittonen, Toshiko Tanaka, Emmi Tikkanen, Nathalie van der Velde, Natasja M. van Schoor, Niek Verweij, Alan F. Wright, Lei Yu, Joseph M. Zmuda, Niina Eklund, Terrence Forrester, Niels Grarup, Anne Jackson, Kati Kristiansson, Teemu Kuulasmaa, Johanna Kuusisto, Peter Lichtner, Jian’an Luan, Anubha Mahajan, Satu Männistö, Cameron D. Palmer, Janina S. Ried, Robert A. Scott, Alena Stančáková, Peter J. Wagner, Ayşe Demirkan, Angela Döring, Vilmundur Guðnason, Douglas P. Kiel, Brigitte Kühnel, Massimo Mangino, Barbara McKnight, Cristina Menni, Jeffrey R. O’Connell, Ben A. Oostra, Alan R. Shuldiner, Kijoung Song, Liesbeth Vandenput, Cornelia M. van Duijn, Péter Vollenweider, Charles C. White, Michael Boehnke, Yvonne Boettcher, Nita G. Forouhi, Christian Gieger, Harald Grallert, Aroon D. Hingorani, Torben Jørgensen, Pekka Jousilahti, Mika Kivimäki, Meena Kumari, Markku Laakso, Claudia Langenberg, Allan Linneberg, Amy Luke, Colin A. McKenzie, Aarno Palotie, Oluf Pedersen, Annette Peters, Konstantin Strauch, Bamidele O. Tayo, Nicholas J. Wareham, David A. Bennett, Lars Bertram, John Blangero, Matthias Blüher, Claude Bouchard, Harry Campbell, Nam H. Cho, Steven R. Cummings, Stefan A. Czerwinski, Ilja Demuth, Rahel Eckardt, Johan G. Eriksson, Luigi Ferrucci, Oscar H. Franco, Philippe Froguel, Ron T. Gansevoort, Torben Hansen, Tamara B. Harris, Nicholas D. Hastie, Markku Heliövaara, Albert Hofman, Joanne M. Jordan, Antti Jula, Mika Kähönen, Eero Kajantie, Paul Knekt, Seppo Koskinen, Péter Kovács, Terho Lehtimäki, Lars Lind, Ching‐Ti Liu, Eric Orwoll, Clive Osmond, Markus Perola, Louis Përusse, Olli T. Raitakari, Tuomo Rankinen, D. C. Rao, Treva Rice, Fernando Rivadeneira, Igor Rudan, Veikko Salomaa, Thorkild I. A. Sørensen, Michael Stümvoll, Anke Tönjes, Bradford Towne, Gregory J. Tranah, Angelo Tremblay, André G. Uitterlinden, Pim van der Harst, Erkki Vartiainen, Jorma SA Viikari, Véronique Vitart, Marie‐Claude Vohl, Henry Völzke, Mark Walker, Henri Wallaschofski, Sarah H. Wild, James F. Wilson, Loïc Yengo, D. Timothy Bishop, Ingrid B. Borecki, John C. Chambers, L. Adrienne Cupples, Abbas Dehghan, Panos Deloukas, Ghazaleh Fatemifar, Caroline S. Fox, Terrence S. Furey, Lude Franke, Jiali Han, David J. Hunter, Juha Karjalainen, Fredrik Karpe, Robert C. Kaplan, Jaspal S. Kooner, Mark I. McCarthy, Joanne M. Murabito, Andrew P. Morris, Julia Newton‐Bishop, Kari E. North, Claes Ohlsson, Ken K. Ong, Inga Prokopenko, J. Brent Richards, Eric E. Schadt, Tim D. Spector, Elisabeth Widén, Cristen J. Willer, Jian Yang, Erik Ingelsson, Karen L. Mohlke, Joel N. Hirschhorn, J. Andrew Pospisilik, M. Carola Zillikens, Cecilia M. Lindgren, Tuomas O. Kilpeläinen, Ruth J. F. Loos
Notice bibliographique
RevueNature Communications · 2016
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité LavalCentre for Global Health ResearchMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute on AgingMünchner Zentrum für GesundheitswissenschaftenNetherlands Heart InstituteDanish Agency for Science and Higher EducationNational Institute of Food and AgricultureNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SHjartaverndVersus ArthritisNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesTurun Yliopistollinen KeskussairaalaBoehringer Ingelheim StiftungOrionin TutkimussäätiöMedical Research CouncilUppsala UniversitetTampereen TuberkuloosisäätiöSydäntutkimussäätiöPaavo Nurmen SäätiöAkademiska SjukhusetDanmarks Frie ForskningsfondVetenskapsrådetCentre for Medical Systems BiologyLi Ka Shing FoundationNovo NordiskAgence Nationale de la RechercheHjärt-LungfondenDeutsche ForschungsgemeinschaftNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekRegion HovedstadenKuopion Yliopistollinen SairaalaNational Center for Research ResourcesCenters for Disease Control and PreventionNierstichtingBritish Heart FoundationBundesministerium für Bildung und ForschungRussian Foundation for Basic ResearchSuomen KulttuurirahastoMinisterie van Economische Zaken, Landbouw en InnovatieDiabetestutkimussäätiöBritish Skin FoundationZonMwInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleKelaSchool of Medicine, Boston UniversityAstraZenecaEuropean CommissionTerveyden ja hyvinvoinnin laitosKing's College LondonCanadian Institutes of Health ResearchDiabetes UKLastentautien TutkimussäätiöNational Institute for Health and Care ResearchNederlandse Zuivel OrganisatieErasmus Medisch CentrumVrije Universiteit AmsterdamStiftelsen för Strategisk ForskningHealth and Safety ExecutiveWageningen University and ResearchCancer Research UKWellcome TrustU.S. Department of AgricultureSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungEmil Aaltosen SäätiöU.S. Department of Veterans AffairsLundbeckfondenLes Laboratories Pierre FabreJohn D. and Catherine T. MacArthur FoundationNational Heart, Lung, and Blood InstituteBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilItä-Suomen YliopistoFoundation for Cardiovascular ResearchSigne ja Ane Gyllenbergin SäätiöGlaxoSmithKlineScottish GovernmentForsknings- og InnovationsstyrelsenFondation de FranceSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådClinical Science Research and DevelopmentNational Science FoundationJuho Vainion SäätiöNovo Nordisk FondenAmerican Heart Association
Mots-clésLink (geometry)DiseaseMedicineEnvironmental healthBiologyInternal medicineGeneticsBioinformaticsComputer science
Résumé
To increase our understanding of the genetic basis of adiposity and its links to cardiometabolic disease risk, we conducted a genome-wide association meta-analysis of body fat percentage (BF%) in up to 100,716 individuals. Twelve loci reached genome-wide significance (P<5 × 10(-8)), of which eight were previously associated with increased overall adiposity (BMI, BF%) and four (in or near COBLL1/GRB14, IGF2BP1, PLA2G6, CRTC1) were novel associations with BF%. Seven loci showed a larger effect on BF% than on BMI, suggestive of a primary association with adiposity, while five loci showed larger effects on BMI than on BF%, suggesting association with both fat and lean mass. In particular, the loci more strongly associated with BF% showed distinct cross-phenotype association signatures with a range of cardiometabolic traits revealing new insights in the link between adiposity and disease risk.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,967
Score d'incertitude au seuil1,000
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations316
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui