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Enregistrement W2289838293 · doi:10.14196/sjas.v5i2.2107

Intestinal microbiota of ornamental fish Carassius auratus

2016· article· en· W2289838293 sur OpenAlexaboutno aff
Dafne Itzel Orozco Rojas, María del Carmen Monroy‐Dosta, Jorge Castro Mejía, Aida Hamdan Partida, Alberto Ramírez Torrez

Notice bibliographique

RevueScientific Journal of Animal Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMicrobiologyAeromonasFirmicutesAeromonas veroniiFood scienceBacteria16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intestinal microbiota is an essential component for any organism life, because it directly affects nutrient assimilation, growth and health processes. However, in many animals and in case of fish is unknown how Intestinal microbiota is formed, which species are dominant and which one has capacity probiotic for use in aquaculture. The goal of this study was to establish the bacterial load that dominates the back intestine of Carassius auratus. A batch of 200 healthyjuvenilefishes were obtained from an ornamental fish farm in Mexico City. The fish were maintained in two culture beakers of 100 L during 15 day to acclimatization to ensure any sign of injury disease. To extract the back of gastrointestinal tract, which was rinse several times with distilled water for food and feces residues elimination. The sample was inoculated in 9 mL of sterile saline solution and from this, three dilutions in a 1:10 relation were made, inoculating 0.1 mL from each dilution in agar plates MRS, BHI and TCBS, and were incubated at 27oC for 24 hours. Subsequently a colony forming units (CFU mL-1) count was made, with the help of a Quebec counter type. Colonies were purified through successive inoculations. The molecular identification was made out by sequencing the gene RNAr 16S using Wizard Genomic. Molecular identification showed that the back region of the intestinal tract of C. auratus was dominated by phylum Proteobacteria and Firmicutes represented by the genus Bacillus , Vibrio , Vagococcus , Brevibacillus , Aeromonas , Pseudomonas , Shewanella , Enterococcus , Paenibacillus and Morganella. In relation to bacterial abundance by specie it was established that Bacillus sp. and Pseudomonas stutzeri were the most abundant reaching CFU mL -1 counts of 210 and 167 respectively, followed by Paenibacillus lactis with 103 CFU mL -1 and Bacillus cereus with 100 CFU mL -1 while Enterococcus eurekensis was the least abundant with an average value of 6 CFU mL -1 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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