Intestinal microbiota of ornamental fish Carassius auratus
Notice bibliographique
Résumé
Intestinal microbiota is an essential component for any organism life, because it directly affects nutrient assimilation, growth and health processes. However, in many animals and in case of fish is unknown how Intestinal microbiota is formed, which species are dominant and which one has capacity probiotic for use in aquaculture. The goal of this study was to establish the bacterial load that dominates the back intestine of Carassius auratus. A batch of 200 healthyjuvenilefishes were obtained from an ornamental fish farm in Mexico City. The fish were maintained in two culture beakers of 100 L during 15 day to acclimatization to ensure any sign of injury disease. To extract the back of gastrointestinal tract, which was rinse several times with distilled water for food and feces residues elimination. The sample was inoculated in 9 mL of sterile saline solution and from this, three dilutions in a 1:10 relation were made, inoculating 0.1 mL from each dilution in agar plates MRS, BHI and TCBS, and were incubated at 27oC for 24 hours. Subsequently a colony forming units (CFU mL-1) count was made, with the help of a Quebec counter type. Colonies were purified through successive inoculations. The molecular identification was made out by sequencing the gene RNAr 16S using Wizard Genomic. Molecular identification showed that the back region of the intestinal tract of C. auratus was dominated by phylum Proteobacteria and Firmicutes represented by the genus Bacillus , Vibrio , Vagococcus , Brevibacillus , Aeromonas , Pseudomonas , Shewanella , Enterococcus , Paenibacillus and Morganella. In relation to bacterial abundance by specie it was established that Bacillus sp. and Pseudomonas stutzeri were the most abundant reaching CFU mL -1 counts of 210 and 167 respectively, followed by Paenibacillus lactis with 103 CFU mL -1 and Bacillus cereus with 100 CFU mL -1 while Enterococcus eurekensis was the least abundant with an average value of 6 CFU mL -1 .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».