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Enregistrement W2290262197 · doi:10.1126/scitranslmed.aad7666

A dominant gain-of-function mutation in universal tyrosine kinase <i>SRC</i> causes thrombocytopenia, myelofibrosis, bleeding, and bone pathologies

2016· article· en· W2290262197 sur OpenAlexaff
Ernest Turro, Daniel Greene, Anouck Wijgaerts, Chantal Thys, Claire Lentaigne, Tadbir K. Bariana, Sarah K. Westbury, Anne M. Kelly, Dominik Selleslag, Jonathan Stephens, Sofia Papadia, Ilenia Simeoni, Christopher J. Penkett, Sofie Ashford, Antony Attwood, Steve Austin, Tamam Bakchoul, Peter Collins, Sri V. V. Deevi, Rémi Favier, Myrto Kostadima, Michele P. Lambert, Mary Mathias, Carolyn M. Millar, Kathelijne Peerlinck, David J. Perry, Sol Schulman, Deborah Whitehorn, Christine Wittevrongel, Marc De Maeyer, Augusto Rendon, Keith Gomez, Wendy N. Erber, Andrew Mumford, Paquita Nurden, Kathleen Stirrups, John R. Bradley, F. Lucy Raymond, Michael Laffan, Chris Van Geet, Sylvia Richardson, Kathleen Freson, Willem H. Ouwehand

Notice bibliographique

RevueScience Translational Medicine · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Lymphocytic Leukemia Research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNIHR Cambridge Biomedical Research CentreNIHR BioResourceVlaamse regeringFonds Wetenschappelijk OnderzoekOnderzoeksraad, KU LeuvenImperial College LondonBritish Heart FoundationKU LeuvenNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research CouncilBritish Society for HaematologyNHS Blood and Transplant
Mots-clésMyelofibrosisGain of functionMedicineProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcTyrosine kinaseMutationFunction (biology)PlateletCancer researchInternal medicineBone marrowBiologyReceptorGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Src family kinase (SFK) member SRC is a major target in drug development because it is activated in many human cancers, yet deleterious SRC germline mutations have not been reported. We used genome sequencing and Human Phenotype Ontology patient coding to identify a gain-of-function mutation in SRC causing thrombocytopenia, myelofibrosis, bleeding, and bone pathologies in nine cases. Modeling of the E527K substitution predicts loss of SRC's self-inhibitory capacity, which we confirmed with in vitro studies showing increased SRC kinase activity and enhanced Tyr(419) phosphorylation in COS-7 cells overexpressing E527K SRC. The active form of SRC predominates in patients' platelets, resulting in enhanced overall tyrosine phosphorylation. Patients with myelofibrosis have hypercellular bone marrow with trilineage dysplasia, and their stem cells grown in vitro form more myeloid and megakaryocyte (MK) colonies than control cells. These MKs generate platelets that are dysmorphic, low in number, highly variable in size, and have a paucity of α-granules. Overactive SRC in patient-derived MKs causes a reduction in proplatelet formation, which can be rescued by SRC kinase inhibition. Stem cells transduced with lentiviral E527K SRC form MKs with a similar defect and enhanced tyrosine phosphorylation levels. Patient-derived and E527K-transduced MKs show Y419 SRC-positive stained podosomes that induce altered actin organization. Expression of mutated src in zebrafish recapitulates patients' blood and bone phenotypes. Similar studies of platelets and MKs may reveal the mechanism underlying the severe bleeding frequently observed in cancer patients treated with next-generation SFK inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations144
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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