Characterizing Y532H disease‐causing mutation and N‐terminal domains of the human Wilson protein
Notice bibliographique
Résumé
The human Wilson protein (ATP7B) is a copper transporting ATPase that is involved in copper homeostasis. Mutations in the gene coding for this protein leads to Wilson Disease (WD), a hepatological disorder characterized by impaired excretion of copper in bile. We characterized Y532H disease‐causing mutant, and its interaction with a copper chaperone, HAH1 (also known as Atox1). We examined structural effects of Y532H mutation in domains 5 and 6 wild type construct of ATP7B. It was found that the mutation alters the solubility of the expressed protein, decrease overall protein stability as observed by circular dichroism (CD) spectroscopy and does not interfere with copper binding. The 15 N HSQC experiments by NMR reveal an essentially folded protein, a phenomenon also supported by CD experiments. The amide chemical shifts are highly similar between the wild type and mutant WLN5‐6 for the domain 6 (G80‐Q149), as shown by chemical shift variation (CSV) data, and the most affected amino residues are those spatially close to mutation which includes Q4‐F7, K47‐H(Y)48 (mutation) and V52‐I53. In conclusion, the Y532H mutation is perceived to perturb the hydrogen bond network in domain 5, which is critical for a compact structure, thus inducing motions on the side chains and break the linkage between two domains, causing inter‐domain motion and structural heterogeneity, which is absent in the wild type. (This work was supported by Wilson's disease Association grant)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».