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Enregistrement W2290809822 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.521.5

Characterizing Y532H disease‐causing mutation and N‐terminal domains of the human Wilson protein

2010· article· en· W2290809822 sur OpenAlexaff
Joshua Muia, David L. Huffman, Lucia Banci, Ivano Bertini, Shenlin Wang

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantMutationChemistryWild typeProtein structureCrystallographyProtein foldingMenkes diseaseHeteronuclear single quantum coherence spectroscopyCircular dichroismCopperBiophysicsBiologyGeneticsGeneBiochemistryStereochemistryNuclear magnetic resonance spectroscopy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human Wilson protein (ATP7B) is a copper transporting ATPase that is involved in copper homeostasis. Mutations in the gene coding for this protein leads to Wilson Disease (WD), a hepatological disorder characterized by impaired excretion of copper in bile. We characterized Y532H disease‐causing mutant, and its interaction with a copper chaperone, HAH1 (also known as Atox1). We examined structural effects of Y532H mutation in domains 5 and 6 wild type construct of ATP7B. It was found that the mutation alters the solubility of the expressed protein, decrease overall protein stability as observed by circular dichroism (CD) spectroscopy and does not interfere with copper binding. The 15 N HSQC experiments by NMR reveal an essentially folded protein, a phenomenon also supported by CD experiments. The amide chemical shifts are highly similar between the wild type and mutant WLN5‐6 for the domain 6 (G80‐Q149), as shown by chemical shift variation (CSV) data, and the most affected amino residues are those spatially close to mutation which includes Q4‐F7, K47‐H(Y)48 (mutation) and V52‐I53. In conclusion, the Y532H mutation is perceived to perturb the hydrogen bond network in domain 5, which is critical for a compact structure, thus inducing motions on the side chains and break the linkage between two domains, causing inter‐domain motion and structural heterogeneity, which is absent in the wild type. (This work was supported by Wilson's disease Association grant)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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