pH Micro‐Environments Associated with Transport Activity of the Erythrocyte Membrane Cl <sup>−</sup> /HCO <sub>3</sub> <sup>−</sup> Exchanger, AE1
Notice bibliographique
Résumé
Cl − /HCO 3 − exchange proteins (AEs) interact with carbonic anhydrases (CAs) to maximize HCO 3 − transport. CAs catalyse the hydration of CO 2 to HCO 3 − and H + . We hypothesize that rapid AE1‐mediated HCO 3 − transport causes differences in pH between the region around AE1 and the rest of the cell (pH micro‐environments). To examine this possibility we have measured intracellular pH during HCO 3 − transport using pH‐sensitive fluorescent proteins (FPs) localized to unique cellular locations. We have identified a FP, deGFP4, that reports on pH without interference from other ions; deGFP4 had a Stern‐Volmer (Ksv) quenching constant of 5×10 7 M −1 for H + and 0.5 M −1 for Cl − . We constructed deGFP4 fusion proteins to: AE1 N‐terminus (measures pH at the cytosolic surface of AE1), the nucleoside transporter hCNT3 (a spectator protein), calnexin C‐terminus (to probe pH at the cytosolic ER surface), a GPI‐linked construct (to probe pH at the extracellular surface), and deGFP4 alone (cytosolic pH). The AE1‐deGFP4 and cytosolic deGFP4 exhibit an average transport rate of 0.5 pH units/min with an overall change in pH of 0.8 pH units. A new pH‐sensitive red FP (RFP) was recently developed and has been used as a cytosolic pH sensor, and as a fusion to hCNT3. pH was measured simultaneously in distinct regions of the cell using both GFP and RFP fusion proteins. This research is supported by the Canadian Institutes of Health Research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».