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Enregistrement W2295694156 · doi:10.1111/mmi.13348

Signaling by the heavy‐metal sensor CusS involves rearranged helical interactions in specific transmembrane regions

2016· article· en· W2295694156 sur OpenAlexfundno aff
Danny K. Fung, Yongzheng Ma, Tingying Xia, Aixin Yan

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKrell InstituteDivision of ChemistryHealth and Medical Research FundHealth Canada
Mots-clésBiologyTransmembrane proteinTransmembrane domainComputational biologyCell biologyGeneticsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two-component systems (TCSs) play important roles in the adaptation of bacteria to stress. Despite their increasingly well understood mechanistic features, it remains poorly understood how TCSs transduce signals across membranes. Here, we use the E. coli Cu/Ag-responsive CusSR TCS as a model to investigate the roles of CusS transmembrane (TM) residues. Proline scanning of TM1 domain led to identification of the T17P, F18P, and S21P variants, which display higher kinase activities relative to wild type. A single point mutation, V202G, in the adjacent TM2 domain specifically suppresses the hyperactivities of these mutants. Disulfide crosslinking analysis demonstrated that T17 and V202 are situated in close proximity, and Cys residues substituted at those two positions form exclusive intramolecular crosslinks when CusS is in the signaling-inactive state. In the signaling-active variant of CusS, however, only intermolecular crosslinking between the two Cys residues could be observed, suggesting that destabilization of an intramolecular constraint and a subsequent rearrangement of helical interactions in this TM region is involved in the activation of CusS. An analogous TM helical interface in the P. aeruginosa heavy metal sensor kinase CzcS is also observed. Together, these results suggested a conserved transmembrane signal transduction mechanism in the heavy metal sensing TCSs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,126
Score d'incertitude au seuil0,545

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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