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Enregistrement W2295875151 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.513.2

Mechanistic studies on UDP‐Galactopyranose mutases from Aspergillus fumigatus and Trypanosoma cruzi

2010· article· en· W2295875151 sur OpenAlexaff
Michelle Oppenheimer, Allison Blumer, Myles B. Poulin, Richard F. Helm, Todd L. Lowary, Pablo Sobrado

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutaseBiologyVirulenceAspergillus fumigatusFlavoproteinBiochemistryTrypanosoma cruziMicrobiologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UDP‐Galactopyranose mutase (UGM) is a flavoprotein that catalyzes the conversion of UDP‐galactopyranose to UDP‐galactofuranose. UGM serves as the sole biosynthetic source of galactofuranose, which is found on the cell surface of many bacteria, fungi, and parasites. UGM is a unique flavoprotein since it requires the flavin to be reduced for activity, yet no net redox change occurs during catalysis. Currently, the exact mechanism of isomerization is unknown. UGM is also of interest because it is a novel drug target for several diseases due to the importance of galactofuranose for the survival of M. tuberculosis and for virulence of the fungus, A. fumigatus, and the human parasites, such as L. major and T. cruzi . While many studies have been done on the prokaryotic UGM, little is known about eukaryotic UGM. We present, for the first time, the recombinant expression, purification, and characterization of eukaryotic UGMs from A. fumigatus and T. cruzi . We also report limited proteolysis, steady‐state kinetics, rapid‐reaction kinetics, and site‐directed mutagenesis data that demonstrate significant differences between prokaryotic and eukaryotic UGMs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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