Synthesis and testing of isofagomine and derivatives as inhibitors of human glucocerebrosidase
Notice bibliographique
Résumé
Gaucher disease is a lysosomal storage disorder in which the activity of the enzyme glucocerebrosidase (GCase) is deficient. As a result, the substrate of GCase, glucosylceramide, accumulates in lysosomes of Gaucher patients, causing enlargement of the spleen and liver, bone deformity and neurodegeneration. Deficient GCase activity results from point mutations in the gene encoding for GCase, which cause the protein to be misfolded. The misfolded mutant form of GCase, although catalytically competent, is identified and degraded by the endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) pathway; thereby never reaching the lysosome or its substrate, resulting in accumulation. A threshold GCase activity level of 11-15% is all that is needed in order to be asymptomatic, with most Gaucher patients retaining between 5-20% of GCase activity levels. Therefore, therapeutic treatment of Gaucher disease only needs to impart modest increases in GCase activity in order to see large clinical improvements. An emerging therapy for Gaucher disease uses competitive enzyme inhibitors as pharmacological chaperones (PCs), which act to increase GCase levels in the lysosome. The PC binds and stabilizes the native, folded form of GCase, thereby allowing the enzyme to escape ERAD and resume proper trafficking to the lysosome. Once the mutant GCase/PC complex is delivered to the lysosome, the relatively high concentration of accumulated glucosylceramide will compete for the active site of GCase, thereby displacing the PC as normal glycolipid degradation activity resumes. Isofagomine (IFG), a known competitive inhibitor of GCase, was synthesized along with five other C6-alkyl IFG derivatives; of which four lEG derivatives were novel compounds. All six compounds were shown to be potent competitive inhibitors of GCase with measured K, values ranging from 0.2 nM to 610 nM. As a strategy to suppress any inhibitory effects of the PCs after GCase reaches the lysosome, a potentially pH-labile acetal moiety was incorporated into IFG. Unfortunately, the synthesized acetal is very stable and unlikely to cleave under physiological conditions. All molecules synthesized,have been, or will be, sent to our collaborators, Dr. Mike Tropak and Dr. Don Mahuran at the Hospital for Sick Children in Toronto for PC activity testing in Gaucher cell lines.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».