MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2296031899 · doi:10.14288/1.0061636

Synthesis and testing of isofagomine and derivatives as inhibitors of human glucocerebrosidase

2009· article· en· W2296031899 sur OpenAlexaboutno aff
Tara G. Hill

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlucocerebrosidaseChemistryBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gaucher disease is a lysosomal storage disorder in which the activity of the enzyme glucocerebrosidase (GCase) is deficient. As a result, the substrate of GCase, glucosylceramide, accumulates in lysosomes of Gaucher patients, causing enlargement of the spleen and liver, bone deformity and neurodegeneration. Deficient GCase activity results from point mutations in the gene encoding for GCase, which cause the protein to be misfolded. The misfolded mutant form of GCase, although catalytically competent, is identified and degraded by the endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) pathway; thereby never reaching the lysosome or its substrate, resulting in accumulation. A threshold GCase activity level of 11-15% is all that is needed in order to be asymptomatic, with most Gaucher patients retaining between 5-20% of GCase activity levels. Therefore, therapeutic treatment of Gaucher disease only needs to impart modest increases in GCase activity in order to see large clinical improvements. An emerging therapy for Gaucher disease uses competitive enzyme inhibitors as pharmacological chaperones (PCs), which act to increase GCase levels in the lysosome. The PC binds and stabilizes the native, folded form of GCase, thereby allowing the enzyme to escape ERAD and resume proper trafficking to the lysosome. Once the mutant GCase/PC complex is delivered to the lysosome, the relatively high concentration of accumulated glucosylceramide will compete for the active site of GCase, thereby displacing the PC as normal glycolipid degradation activity resumes. Isofagomine (IFG), a known competitive inhibitor of GCase, was synthesized along with five other C6-alkyl IFG derivatives; of which four lEG derivatives were novel compounds. All six compounds were shown to be potent competitive inhibitors of GCase with measured K, values ranging from 0.2 nM to 610 nM. As a strategy to suppress any inhibitory effects of the PCs after GCase reaches the lysosome, a potentially pH-labile acetal moiety was incorporated into IFG. Unfortunately, the synthesized acetal is very stable and unlikely to cleave under physiological conditions. All molecules synthesized,have been, or will be, sent to our collaborators, Dr. Mike Tropak and Dr. Don Mahuran at the Hospital for Sick Children in Toronto for PC activity testing in Gaucher cell lines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuecIRcle (University of British Columbia)Même sujetCarbohydrate Chemistry and SynthesisTravaux en français237 207