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Enregistrement W2296091027 · doi:10.14288/1.0135647

Lipid and acetate metabolism influence host colonization by the fungal plant pathogen Ustilago maydis

2014· article· en· W2296091027 sur OpenAlexaff
Scott C. Lambie

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUstilagoColonizationHost (biology)PathogenBiologyFungal pathogenMicrobiologyLipid metabolismBotanyEcologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ustilago maydis is an obligate fungal pathogen of maize that causes disease known as the common smut of corn. Haploids with compatible mating loci fuse to form a dikaryotic cell type that is filamentous and pathogenic; invasion of the host by this cell type leads to the formation of tumors which contain diploid teliospores. Colonization of the plant presents numerous challenges for U. maydis because the host environment may be limited in nutrients and plant defense responses lead to the creation of toxic molecules such as reactive oxygen species (ROS). Understanding the mechanisms employed by U. maydis to overcome such obstacles is necessary to develop strategies to fight smut disease and protect crops from disease caused by fungal plant pathogens. This study focused on the characterization of a group of genes encoding phospholipases (PLs), enzymes which have been implicated in virulence, morphogenesis and nutrient acquisition of a number of pathogenic fungi. This work included a characterization of one PL, Lip2, which may function to repair ROS-induced damage of membranes that occurs during host colonization. Mutants defective in lip2 were less virulent in maize seedlings, showed sensitivity to H₂O₂ and the drugs chloroquine and quinacrine, and were resistant to ionic stress. A transcriptional profile of a Δlip2 mutant suggested that Lip2 contributes to stress responses and carbon metabolism. Furthermore, lipidomic profiles of the Δlip2 mutant revealed changes in lipid composition that may be linked to the mutant phenotypes. Other aspects of central carbon metabolism were also explored including the utilization of acetate as a carbon source by U. maydis and the role of an ATP-citrate lyase, Acl1, in pathogenesis and fungal development. Acetate had a repressive effect on mating and filamentation, and promoted reduced growth and virulence compared to favorable carbon sources such as glucose. Furthermore, Acl1 was shown to be essential to cause disease and for growth on glucose. Overall, this study reveals potential mechanisms employed by U. maydis during plant colonization to resist the defense response. It also highlights the utility U. maydis as a model system to understand the metabolic and nutritional aspects of fungal phytopathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,153
Écart entre enseignants0,149 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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