Intein‐mediated creation of a cyclic acyl carrier protein
Notice bibliographique
Résumé
Acyl carrier protein (ACP) is an essential protein in bacterial metabolism, where it acts as the major donor for fatty acyl groups in the synthesis of lipids and other specialized products. As such, ACP is an attractive anti‐microbial drug target. ACP normally encloses attached fatty acyl groups in a hydrophobic pocket within its three mainα‐helices, but the exact mechanism of interaction and acyl transfer from ACP to partner enzymes is poorly understood. ACP interacts with most proteins through its acidic helix II, and acyl transfer must involve partial or full unfolding of ACP in order to present the acyl chain to the partner enzyme. To examine the requirement of ACP unfolding for acyl transfer, we created a cyclic version of Vibrio harveyi ACP using split‐intein technology. Mass spectrometry, circular dichroism and fluorescence studies suggest that cyclic ACP (cACP) is trapped in a folded conformation. In vitro characterization indicates that cACP can be modified by holo‐ACP synthetase yielding an active ACP. Furthermore, in vivo complementation assays suggest that cACP is able to replace the linear wild‐type ACP and support growth. Our results thus suggest that cACP is able to interact with and transfer its acyl chain to its many partner enzymes within the bacterial cell despite constraining of its N‐ and C‐termini. (Supported by CIHR, NSERC, and an IWK Studentship).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».