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Enregistrement W2298075793

AN OVERVIEW OF DRUG BINDING TO HUMAN SERUM ALBUMIN: PROTEIN FOLDING AND UNFOLDING

2007· article· en· W2298075793 sur OpenAlexaff
H A Tajmir Riahi

Notice bibliographique

RevueScientia Iranica · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Interaction Studies and Fluorescence Analysis
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHuman serum albuminChemistryCircular dichroismBinding constantChromatographyNuclear chemistryBiochemistryBinding site
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human Serum Albumin (HSA) is a principal extracellular protein with a high concentration in blood plasma and a carrier of many drugs to different molecular targets. Drug binding to HSA can alter the protein biophysical and biochemical properties of protein. The structural analysis of human serum albumin complexes, with naturally occurring flavonoids quercetin(antioxidant), kaempferol (antioxidant), delphinidin (antioxidant), AZT (3'-azido-3'-deoxythymidine) (anti-AIDS), aspirin (anti inflammatory), taxol (anticancer), cisplatin (anticancer), atrazine (herbicide), 2,4-D (herbicide), polyamines (biogenic), chlorophyll (antimutagenic), chlorophyllin (antitumor), poly(ethylene glycol) (polymer), vandyl cation and vanadate anion in aqueous solution are reported. Using capillary electrophoresis, FTIR (Fourier transform infrared), UV-Visible and CD (Circular dichroism) spectroscopic methods, the drug binding mode, the binding constant and the effects of drug complexation on protein secondary structure are determined. The concentrations of HSA used were 0.6 to 0.3 mM, while different drug concentrations were 1~$mu$M to 1 mM. Structural analysis showed drugs are mostly located along the polypeptide chains, with both specific and non-specific interactions. The stability of drug-HSA complexes were in the order: K_VO^2+=1.2times 10^8M^-1 > K_AZT=1.9 times 10^6M^-1>K_del=4.7times 10^5M^-1>K_PEG=4.1times 10^5M^-1>K_kae=2.6times 10^5M^-1>K_que=1.4times 10^5M^-1>K_atrazine=3.5times 10^4M^-1>K_chlorophyll=2.9times 10^4M^-1>K_2,4-D=2.5times 10^4M^-1>K_spermine=1.7times 10^4M^-1>K_taxol=1.43times 10^4M^-1>K_aspirin=1.04times 10^4M^-1>K_chlorophyllin=7.0times 10^3M^-1>K_VO3^-=6.0times 10^3M^-1>K_spermidine=5.4times 10^3M^{-1}>K_putrescine=3.9times 10^3M^1>K_cisplatin=1.2times 10^2M^-1. At low drug concentration (1 muM), protein conformation was not altered (infrared and CD results), while, at high drug content(1 mM), a major reduction of alpha-helix from 60-55% (free HSA) to 49-40% and an increase of beta-structure from 22-15% (free HSA) to 33-23% in the drug-protein complexes occurred. These observations indicated that low drug content induced protein stabilization (folding), whereas, at high drug concentration, a partial protein destabilization (unfolding)occurred in these drug-HSA complexes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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