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Enregistrement W2301681798 · doi:10.18632/oncotarget.8006

Genomic markers of panitumumab resistance including ERBB2/HER2 in a phase II study of KRAS wild-type (wt) metastatic colorectal cancer (mCRC)

2016· article· en· W2301681798 sur OpenAlexafffundabout
Garrett Barry, Maggie C.U. Cheang, Hector Li Chang, Hagen F. Kennecke

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Treatments and Studies
Établissements canadiensBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBC Cancer AgencyCancer Research UKBC Cancer FoundationAmgenAmgen CanadaCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Mots-clésKRASPanitumumabColorectal cancerMedicineInternal medicineOncologyCancerCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Garrett S. Barry 1 , Maggie C. Cheang 2 , Hector Li Chang 1 , Hagen F. Kennecke 3 1 Department of Pathology and Laboratory Medicine, Faculty of Medicine, University of British Columbia, Vancouver, BC V6T 2B5, Canada 2 The Institute of Cancer Research, Sutton, London, Surrey SM2 5NG, United Kingdom 3 Medical Oncology, BC Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4E6, Canada Correspondence to: Hagen F. Kennecke, e-mail: hkennecke@bccancer.bc.ca Keywords: mCRC, nanostring, ERBB2, HER2, EGFR inhibitor resistance Received: October 19, 2015      Accepted: January 29, 2016      Published: March 09, 2016 ABSTRACT A prospective study was conducted to identify biomarkers associated with resistance to panitumumab monotherapy in patients with metastatic colorectal cancer (mCRC). Patients with previously treated, codon 12/13 KRAS wt, mCRC were prospectively administered panitumumab 6 mg/kg IV q2weeks. Of 34 panitumumab-treated patients, 11 (32%) had progressive disease at 8 weeks and were classified as non-responders. A Nanostring nCounter-based assay identified a 5-gene expression signature ( ERBB2 , MLPH, IRX3 , MYRF , and KLK6 ) associated with panitumumab resistance ( P = 0.001). Immunohistochemistry and in situ hybridization determined that the HER2 ( ERBB2 ) protein was overexpressed in 4/11 non-responding and 0/21 responding cases ( P = 0.035). Two non-responding tumors had ERBB2 gene amplification only, and one demonstrated both ERBB2 amplification and mutation. A non-codon 12/13 KRAS mutation occurred in one panitumumab-resistant patient and was mutually exclusive with ERBB2 /HER2 abnormalities. This study identifies a 5-gene signature associated with non-response to single agent panitumumab, including a subgroup of non-responders with evidence of aberrant ERBB2/HER2 signaling. KRAS wt tumors resistant to EGFRi may be identified by gene signature analysis, and the HER2 pathway plays an important role in resistance to therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,119
Score d'incertitude au seuil0,679

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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