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Enregistrement W2301745524 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.959.10

Identification and characterization of a novel Muscle Lamin A/C (LMNA) Interacting Protein (MLIP): A regulator of Pax7

2008· article· en· W2301745524 sur OpenAlexafffund
Elmira Ahmady, Patrick G. Burgon

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLMNAMyogenesisMyoDMyogeninMYF5C2C12MyocyteBiologyLaminGene knockdownSkeletal muscleMolecular biologyCell biologyNuclear laminaNuclear proteinTranscription factorGeneticsCell cultureEndocrinologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Specific missense mutations LMNA have been identified to be associated with muscular dystrophy suggesting that LMNA interacts with a muscle specific factor(s). A yeast two‐hybrid screen with LMNA as bait was employed to identify muscle specific proteins. A previously uncharacterized cDNA clone was identified that interacts with LMNA in muscle, MLIP. Preliminary results show MLIP protein is primarily expressed in brain, heart and skeletal muscle. No structural or functional domains have been identified within MLIP. Objective: To define the function of MLIP in muscle. Results: MLIP is expressed endogenously in a mouse myoblast cell line (C2C12) and is co‐localized to the nuclear envelope and PML bodies. Initiation of C2C12 differentiation led to a 3‐fold increase in MLIP expression peaking at 24hrs and MLIP continued to be expressed in differentiated myotubes. Specific knockdown of MLIP in C2C12 cells by shRNAi led to significant (p<0.01) reduction in Pax7 expression with a concurrent reduction in Myf5, MyoD and myogenin with Pax3 expression being unaffected. To determine whether MLIP is necessary and/or sufficient for myogenic differentiation, stable C2C12 cell lines are being generated that either knockdown MLIP or over‐express MLIP. Conclusion: MLIP is a novel LMNA interacting protein that may regulate Pax7 a myogenic determinant during regenerative myogenesis. Funding: CIHR operating grant to PGB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,142

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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