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Enregistrement W2305231375 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.815.4

Dimerization of the plasma membrane Na <sup>+</sup> /H <sup>+</sup> exchanger type 3 (NHE3)

2010· article· en· W2305231375 sur OpenAlexaff
Victor Babich, I. Alexandru Bobulescu, Daniel G. Fuster, Serge M. Gisler, Olivier Bonny, Donald W. Hilgemann, Igor Štagljar, Orson W. Moe

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryDimerSodium–hydrogen antiporterMutantWild typeBiophysicsTransport proteinTransmembrane proteinMembraneCell biologyBiochemistryBiologyGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many transmembrane transport proteins are known or inferred to function as homo or hetero oligomers. NHE3 has been reported to associate in oligomers. However, the direct NHE3‐NHE3 interaction, the oligomer configuration and the significance of oligomerization for NHE3 function and regulation are unknown. Using split‐ubiquitin yeast two‐hybrid system for membrane protein‐protein interactions and co‐immunoprecipitation in mammalian cells, we demonstrated that full‐length NHE3, its C‐terminal truncations, but not full‐length NHE1, interact with full‐length NHE3 prey and NHE3 exists as an oligomer in mammalian cells. We confirmed that NHE3 is a dimer on the plasma membrane by counting photobleaching steps in total internal reflection fluorescence images of NHE3‐mGFP expressed in NHE‐null cells. In its native state in opossum kidney cells, NHE3 exhibits highly cooperative Na + kinetics compatible with two substrate binding sites. To show functional cross‐talk between two NHE3 molecules in a dimer we used two NHE3 mutants: S552A/S605G (abolished regulation by protein kinase A, PKA) and E213I (transport defective). The transport activity of NHE‐null cells expressing S552A/S605G NHE3 mutant was comparable to wild‐type NHE3, but it was not affected by PKA activation. Co‐expression of both S552A/S605G and E213I NHE3 mutants restored the exchanger activity along with the PKA regulation. These findings suggest that NHE3 is present at the plasma membrane as homo dimers and NHE3 dimers may constitute the functional units of the transport and affect its regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,414

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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