Molecular characterization of the interaction between the rheumatoid arthritis shared epitope and calreticulin (144.7)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Calreticulin (CRT) is a versatile endoplasmic reticulum protein also known as a cell surface receptor for several innate immune system ligands. We have recently reported that the rheumatoid arthritis (RA) shared epitope (SE), a major risk factor for severe RA, acts as a ligand that specifically binds to CRT and activates innate signaling in other cells. To gain better insights into the molecular characteristics of SE-CRT interaction, here, we have mapped the binding site of the SE ligand on CRT. Experiments with CRT domain-deleted mutants and a sulfo-SBED (sulfosuccinimidyl-2-[6-(biotinamido)-2-(p-azido-benzamido) hexanoamido] ethyl-1,3-dithiopropionate) chemical labeling method localized the SE binding site at the CRT P-domain. Computer-assisted 3D docking predicted the region 217-224 in the CRT P-domain as a potential SE binding site. Finally, site-directed mutagenesis demonstrated involvement of residues Glu217 and Glu223 in both cell-free binding and signal transduction assays. We conclude that the region encompassing amino acid residues 217-223 in the CRT P-domain is a binding site of the RA SE, with critical roles played by residues Glu217 and Glu223, which interact with SE residues Gln70 and Arg72, respectively. The SE binding site is distinct from those previously reported for other CRT ligands. The pathogenic implications of the findings will be discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».