Phylogenetic analysis of fungal aquaporins provides insight into their possible role in water transport of mycorrhizal associations
Notice bibliographique
Résumé
In mycorrhizal associations, water transport properties of the fungal hyphae may have a profound effect on water transport of the host plant. The importance of aquaporins, water-transporting members of the major intrinsic protein (MIP) family, in facilitating water transport has been widely acknowledged and extensively studied in plants. However, until recently, relatively little was known about the structure, function, and regulation of fungal MIPs. The rapid increase in the number of sequenced fungal genomes, including Laccaria bicolor and other mycorrhizal fungi, has enabled functional and comparative genomic investigations to delineate the role that fungal MIPs play in mycorrhizal-facilitated plant water transport. Phylogenic analysis of 229 fungal MIPs from 88 species revealed that MIPs of mycorrhizal fungal species fall into four clusters delineated by functionally characterized fungal MIPs: the orthodox aquaporins, the aquaglyceroporins, the facultative fungal aquaporins, and the X intrinsic proteins. This comparative genomics analysis, together with in silico structural characterization of predicted MIPs and recently published functional characterization of MIPs from a small number of ectomycorrhizal and arbuscular mycorrhizal species, provide new insight into MIP gene families of mycorrhizal fungi and possible roles for fungal aquaporins in water relations of mycorrhizal plant–fungus symbioses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».