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Enregistrement W2312823526 · doi:10.1107/s0108767308091320

Structural and mutational studies of anthocyanin malonyltransferases

2008· article· en· W2312823526 sur OpenAlexaff
Hideaki Unno, F. Ichimaida, Haruo Suzuki, Sho Takahashi, Yoko Tanaka, Ayumu Saito, Tomoko Nishino, Masami Kusunoki, Tatsuo Nakayama

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations of Crystallography · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnthocyaninGeneticsComputational biologyBiologyFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

4 4 is a key player in the formation of large complexes on gene promoters leading to chromatin remodelling and gene activation. CARM1 has now been shown to methylate a large variety of proteins which are all vital to gene expression. CARM1 contains 608 amino acids in human and its architecture has been schematically divided into three domains. CARM1 is built around a catalytic core domain that is well conserved in sequence (and therefore in structure) among all PRMTs members. CARM1 possesses two unique additional domains attached, respectively, at the NH2-terminal and at the COOH-terminal end of the PRMT active site. Both NH2-terminal domain and COOHterminal domain have been shown to be required for the coactivator function of human CARM1. We have solved six crystal structures corresponding to three isolated modules of CARM1. Five crystal structures of the CARM1 catalytic module, two free, two cofactor and one inhibitor bound forms have revealed large structural modifications and shown that the NH2-terminal and the COOHterminal end of CARM1 catalytic module contain molecular switches that may inspire how CARM1 regulates its biological activities by protein-protein interactions. Full detailed analysis of the structures will be presented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,791
Score d'incertitude au seuil0,874

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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