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Enregistrement W2312970319 · doi:10.1021/ja405916q

Chemical Insight into the Emergence of Influenza Virus Strains That Are Resistant to Relenza

2013· article· en· W2312970319 sur OpenAlexaff
Fahimeh S. Shidmoossavee, Jacqueline N. Watson, Andrew J. Bennet

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryEnzyme kineticsNeuraminidaseEnzymeStereochemistryMichaelis–Menten kineticsSialic acidNeuraminidase inhibitorSubstrate (aquarium)CatalysisHydrolysisActive siteBiochemistryEnzyme assayBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A reagent panel containing ten 4-substituted 4-nitrophenyl α-D-sialosides and a second panel of the corresponding sialic acid glycals were synthesized and used to probe the inhibition mechanism for two neuraminidases, the N2 enzyme from influenza type A virus and the enzyme from Micromonospora viridifaciens. For the viral enzyme the logarithm of the inhibition constant (Ki) correlated with neither the logarithm of the catalytic efficiency (kcat/Km) nor catalytic proficiency (kcat/Km kun). These linear free energy relationship data support the notion that these inhibitors, which include the therapeutic agent Relenza, are not transition state mimics for the enzyme-catalyzed hydrolysis reaction. Moreover, for the influenza enzyme, a correlation (slope, 0.80 ± 0.08) is observed between the logarithms of the inhibition (Ki) and Michaelis (Km) constants. We conclude that the free energy for Relenza binding to the influenza enzyme mimics the enzyme-substrate interactions at the Michaelis complex. Thus, an influenza mutational response to a 4-substituted sialic acid glycal inhibitor can weaken the interactions between the inhibitor and the viral neuraminidase without a concomitant decrease in free energy of binding for the substrate at the enzyme-catalyzed hydrolysis transition state. The current findings make it clear that new structural motifs and/or substitution patterns need to be developed in the search for a bona fide influenza viral neuraminidase transition state analogue inhibitor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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