Paleoclimate Shaped Bluefish Structure in the Northern Hemisphere
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Bluefish (Pomatomus saltatrix), a highly migratory cosmopolitan predator, is the only extant representative of the family Pomatomidae. It has been the subject of many studies due to its commercial and recreational value, but much less research has been conducted on its global population structure. Here we investigate the population structure of this species and the effects of present and past oceanographic barriers to dispersal in its North Atlantic, Mediterranean, Marmara, and Black sea populations. We employed mitochondrial (cytochrome b and cytochrome oxidase subunit I genes) and nuclear (eight microsatellite loci) DNA as molecular markers. Three main genetic units of Bluefish were identified: American (West Atlantic waters), Spanish (East Atlantic–Western Mediterranean regions), and Turkish (Eastern Mediterranean, Marmara, and Black seas). Our results suggested that Bluefish is panmictic in the northwest Atlantic Ocean but not in the Mediterranean Sea. The common ancestor of the studied populations was traced back to the interglacial cycle Aftonian II, and the separation between clades was estimated to have occurred during glacial periods, likely due to migrations to refuges and the closure of the Mediterranean Sea. In conclusion, paleoclimate seems to have been fundamental for shaping the present genetic lineages of Pomatomus saltatrix. RESUMEN la anjova (Pomatomus saltatrix), un depredador cosmopolita y altamente migratorio, es el único representante vivo de la familia Pomatomidae. Ha sido sujeto de numerosos estudios dado su valor comercial y recreativo, pero poco se sabe acerca de su estructura poblacional a nivel mundial. En este trabajo se investiga la estructura poblacional de esta especie y los efectos que tienen las barreras oceanográficas pasadas y presentes en la dispersión de sus poblaciones hacia el Atlántico Norte, Mediterráneo, Mármara y Mar Negro. Se utilizó ADN mitocondrial (citocromo b y gen citocromo oxidasa subunidad I) y nuclear (ocho loci microsatélites) como marcadores moleculares. Se identificaron tres unidades genéticas principales en la anjova: americana (aguas del Atlántico oeste), española (regiones Atlántico este y Mediterráneo oeste) y turca (Mediterráneo este, Mármara y Mar Negro). Los resultados sugieren que la anjova es panmíctica en el noroeste del Atlántico pero no en el Mar Mediterráneo. El ancestro común de las poblaciones estudiadas se remonta al ciclo interglacial durante el Aftoniano II, y la separación entre clados se estima que ocurrió en periodos glaciales, muy posiblemente debido a las migraciones hacia refugios y al cierre del Mar Mediterráneo. En conclusión, el paleoclima parece haber sido un factor fundamental en cuanto a la determinación de las líneas genéticas actuales de Pomatomus saltatrix.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».