Phylogenetic classification of <i>Pleurothecium</i> and <i>Pleurotheciella</i> gen. nov. and its dactylaria-like anamorph (Sordariomycetes) based on nuclear ribosomal and protein-coding genes
Notice bibliographique
Résumé
Two strains of an unidentified perithecial ascomycete with a dactylaria-like anamorph and another morphologically similar strain of a dactylaria-like fungus were collected on decaying wood submerged in freshwater. To study their phylogenetic relationships we (i) combined sequence data from the nuclear small and large subunits ribosomal DNA (nc18S and nc28S) and the second largest subunit of RNA polymerase II (RPB2) for a multigene phylogenetic analysis and (ii) used sequences of the internal transcribed spacer region (ITS) of the rRNA operon for a species-level analysis. The new genus Pleurotheciella is described for two new species, Pla. rivularia and Pla. centenaria, with nonstromatic perithecia, unitunicate asci, persistent paraphyses and hyaline, septate ascospores and dactylaria-like anamorphs characterized by holoblastic, denticulate conidiogenesis, subhyaline conidiophores and hyaline, septate conidia. Based on morphological and molecular data, Pleurotheciella is closely related to the genera Pleurothecium and Sterigmatobotrys. A key to the three genera and the known species is provided. In the three-gene inferred phylogeny, these genera grouped as a sister clade to the Savoryellales within a robust clade of uncertain higher rank affiliation. Phylogenetic study of the 12 strains that represent Pleurothecium recurvatum revealed four that grouped apart from the core of the species. Two of these strains, which form a monophyletic well supported clade in both phylogenies and share similar morphological characteristics, are described as a new species, Pleurothecium semifecundum.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».