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Enregistrement W2313183294 · doi:10.1021/jp109531b

Alteration of the H-Bond to the A<sub>1A</sub> Phylloquinone in Photosystem I: Influence on the Kinetics and Energetics of Electron Transfer

2011· article· en· W2313183294 sur OpenAlexaff
Nithya Srinivasan, Stefano Santabarbara, Fabrice Rappaport, Donatella Carbonera, Kevin Redding, Art van der Est, John H. Golbeck

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésElectron transferChemistryArrhenius plotKineticsElectron paramagnetic resonanceArrhenius equationSpectroscopyPhotosystem IIPhotochemistryCrystallographyActivation energyPhysical chemistryNuclear magnetic resonancePhysicsPhotosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Photosystem I, the backbone nitrogen of Leu722(PsaA) forms a hydro-gen bond with the C(4) carbonyl oxygen of phylloquinone in the A(1A) site. A previous low-temperature EPR study indicated that substitution of Leu722(PsaA) with a bulky Trp residue results in a weakened H-bond. Here, we employ room temperature, time-resolved optical spectroscopy and variable temperature, transient EPR spectroscopy to probe the effect of the altered H-bond on the energetics and kinetics of electron transfer. Relative to the wild type, we find that the rate of electron transfer from A(1A)(-) to F(X) in the L722W(PsaA) variant is faster by a factor of 3. This change is attributed to a lowered midpoint potential of A(1A)/A(1A)(-), resulting in a larger Gibbs free energy change between A(1A)/A(1A)(-) and F(X)/F(X)(-). An activation energy of 180±10 meV is determined for the A(1A)(-)-to-F(X) forward electron transfer step in the L722W(PsaA) variant compared with 220±10 meV in the wild type. The Arrhenius plot shows a break at ∼200 K, below which the rate becomes nearly independent of temperature. This behavior is described using a quantum mechanical treatment that takes the zero-point energy into account as well as an alternative model that invokes a dynamical transition in the protein at ∼200 K.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,213

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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