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Enregistrement W2314662733 · doi:10.1158/1538-7445.am10-5010

Abstract 5010: Nucleophosmin (NPM) is univerally deregulated in acute promyelocytic leukemia

2010· article· en· W2314662733 sur OpenAlexaff
Mahadeo A. Sukhai, Mariam Thomas, Yali Xuan, Shevani Mahindra, Tong Zhang, Patrícia P. Reis, Mark D. Minden, Suzanne Kamel‐Reid

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleophosminRibosome biogenesisBiologyAcute promyelocytic leukemiaCancer researchCell biologyCell cultureMolecular biologyRetinoic acidMyeloid leukemiaRibosomeGeneticsRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract NPM is a multifunctional nucleolar phosphoprotein with roles in ribosome biogenesis, centrosome duplication, p53 response and DNA repair, and is commonly mutated in Acute myelogenous leukemia (AML). NPM is juxtaposed with retinoic acid receptor α (RARα[[Unsupported Character - [[Unsupported Character - ]]]]) in Acute Promyelocytic Leukemia (APL), raising the possibility that NPM functions are disrupted in this leukemia. We sought to determine the extent of NPM deregulation in the U937-NPM-RARα+ cell line model, and to extend this analysis more generally to APL. Immunofluorescent microscopy (IF) demonstrated abnormal distribution of NPM in patient-derived APL cells carrying NPM-RARα or PML-RARα, as well as cell lines expressing X-RARα: NPM was distributed into abnormally large aggregates within the nucleus and/or throughout the cytoplasm. NPM distribution reverted to normal after 48 hr of treatment with 1.0 μM all-trans retinoic acid (ATRA). NPM protein levels were also significantly increased in X-RARα+ cell lines. This may by due to an alteration at the protein level, as NPM mRNA expression was unaffected by X-RARα, and no mutations were detected in the NPM locus. Indeed, we found that NPM protein half-life was increased in U937 cells expressing X-RARα. These data suggested a potential disruption in nucleolar architecture in APL cells. Alterations in size and number of nucleolar organizing regions (NORs) in NB4 and U937-X-RARα cells were evident, when compared to U937 controls. Defects in nucleolar organization may lead to altered ribosome biogenesis, protein synthesis, as well as cell size and proliferation. Ribosomal RNA precursor expression was found to be increased significantly in U937-NPM-RARα cells, compared to controls. Relative cell volume, assessed by a flow cytometric assay, was moderately increased, by approximately 10% in NPM-RARα+ cells, while cell proliferation rates were significantly increased, and doubling time decreased, compared to U937 controls. Analysis of protein synthesis rates in U937-NPM-RARα+ cells indicated that the incorporation of a fluorescent Methionine analogue was twice that in control U937 cells. Finally, in order to determine the applicability of our in vitro results to APL patients, we analyzed pre-rRNA and 18S rRNA expression in bone marrow RNA extracted at diagnosis from 16 APL patients (10 BCR1/2 and 6 BCR3), in order to determine whether elevated nucleolar function was found in APL. 10/16 APLs had elevated 18S rRNA levels (>1.5-fold compared to normal BM); 8/16 had similarly elevated pre-rRNA levels. Overall, pre-rRNA levels were elevated an average of 2-fold compared to normal controls, while 18S rRNA levels were elevated an average 1.8-fold (p < 0.05 for both comparisons). We therefore present the first evidence that NPM may be universally deregulated in APL, leading to defective NPM function within the leukemic cell. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 5010.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,689

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
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