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Enregistrement W2314930416 · doi:10.1021/jp4065467

Poly(4-styrenesulfonate) as an Inhibitor of Aβ40 Amyloid Fibril Formation

2013· article· en· W2314930416 sur OpenAlexaff
Bimlesh Ojha, Haiyang Liu, Samrat Dutta, Praveen P. N. Rao, Ewa P. Wojcikiewicz, Deguo Du

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesFlorida Atlantic University
Mots-clésPolyelectrolyteChemistryAmyloid (mycology)Amyloid fibrilFibrilSide chainProtein aggregationBiophysicsPeptideMacromoleculeMolecular dynamicsHydrophobic effectAmyloid βBiochemistryOrganic chemistryPolymerComputational chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The formation of amyloid, a cross-β-sheet fibrillar aggregate of proteins, is associated with a variety of neurodegenerative diseases. Amyloidogenic proteins such as β-amyloid (Aβ) are known to exist with a large amount of polyelectrolyte macromolecules in vivo. The exact nature of Aβ-polyelectrolyte interactions and their roles in Aβ-aggregation are largely unknown. In this regard, we report the inhibiting effect of an anionic polyelectrolyte poly(4-styrenesulfonate) (PSS) on the aggregation of Aβ40 peptide. The results demonstrate the strong inhibition potential of PSS on the aggregation of Aβ40 and imply the dominant role of hydrophobicity of the polyelectrolyte in reducing the propensity of Aβ40 amyloid formation. Additional studies with poly(vinyl sulfate) (PVS) and p-toluenesulfonate (PTS), which share similar charge density with PSS except the former lacking the nonpolar aromatic side chain and the latter the aliphatic hydrocarbon backbone, reveal that the presence of both aliphatic backbone and aromatic side chain group in PSS is essential for its Aβ-aggregation inhibition activity. The interactions involved in the Aβ40-PSS complex were further investigated using molecular dynamics (MD) simulation. Our results provide new insights into the structural interplay between polyelectrolytes and Aβ peptide, facilitating the ultimate understanding of amyloid formation in Alzheimer's disease. The results should assist in developing novel polyelectrolytes as potential chemical tools to study amyloid aggregation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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