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Enregistrement W2315189679 · doi:10.1021/ct200569x

Cation−π and π–π Interactions in Aqueous Solution Studied Using Polarizable Potential Models

2011· article· en· W2315189679 sur OpenAlexafffund
Esam A. Orabi, Guillaume Lamoureux

Notice bibliographique

RevueJournal of Chemical Theory and Computation · 2011
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueSpectroscopy and Quantum Chemical Studies
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies
Mots-clésChemistryAqueous solutionPolarizabilityMoleculeDimerComputational chemistryIonAb initioBenzenePotential of mean forceChemical physicsWater dimerInteraction energyCooperativityMolecular dynamicsAffinitiesAb initio quantum chemistry methodsBinding energyPhysical chemistryHydrogen bondStereochemistryOrganic chemistryAtomic physicsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polarizable potential models for the interaction of Li(+), Na(+), K(+), and NH4(+) ions with benzene are parametrized based on ab initio quantum mechanical calculations. The models reproduce the ab initio complexation energies and potential energy surfaces of the cation-π dimers. They also reproduce the cooperative behavior of "stacked", cation-π-π trimers and the anticooperative behavior of "sandwiched", π-cation-π trimers. The NH4(+) model is calibrated to reproduce the energy of the NH4(+)-H2O dimer and yields correct free energy of hydration and hydration structure without further adjustments. The models are used to investigate cation-π interactions in aqueous solution by calculating the potential of mean force between each of the four cations and a benzene molecule and by analyzing the organization of the solvent as a function of the cation-benzene separation. The results show that Li(+) and Na(+) ions are preferentially solvated by water and do not associate with benzene, while K(+) and NH4(+) ions bind benzene with 1.2 and 1.4 kcal/mol affinities, respectively. Molecular dynamics simulations of NH4(+) and of K(+) in presence of two benzene molecules in water show that cation-π and π-π affinities are mutually enhanced compared to the pairwise affinities, confirming that the cooperativity of cation-π and π-π interactions persists in aqueous solution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,733
Score d'incertitude au seuil0,223

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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