Some fungi express β-1,3-glucanases similar to thaumatin-like proteins
Notice bibliographique
Résumé
Mycelial clarified homogenates from Lentinus edodes, Agaricus bisporus, Rhizoctonia solani and extracts from commercial sources of lysing enzymes from Rhizoctonia solani or Irpex lacteus contained enzymes of ca 25 kDa hydrolyzing polymeric carboxy-methylated (CM)-pachyman with an in-gel β-1,3-glucanase assay. Proteins were purified from Rhizoctonia solani, Lentinus edodes and Irpex lacteus and their Nterminal amino acid sequences showed homology to thaumatin-like (TL) proteins. As with plant TL proteins with β-1,3-glucanase activity, little or no activity was observed on oligomeric laminarin by the in-gel hydrolase assay. The fungal TL proteins varied in specific activity from 60 to 760 nkat mg-1 with CM-pachyman as substrate and were thus more active than most plant TL proteins. Thin-layer chromatography indicated that the fungal TL proteins generated various oligoglucosides from an endo β-1,3-glucanase activity. The TL proteins were detected in several, but not all, anastomosis groups of Rhizoctonia solani. The purified Rhizoctonia solani TL protein was the most potent enzyme, inhibiting the growth of Saccharomyces cerevisiae when compared to two fungal or three plant TL proteins. Moreover, the Rhizoctonia TL protein was able to hydrolyze live Saccharomyces yeast cells. This is the first report of fungal TL proteins with endo-β-1,3-glucanase activity and strong binding to polymeric β-1,3-glucans.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».