Molecular phylogeny of black flies in the<i>Simulium tuberosum</i>(Diptera: Simuliidae) species group in Thailand
Notice bibliographique
Résumé
Black flies are medically and ecologically significant insects. They are also interesting from an evolutionary standpoint regarding the role of chromosomal change and ecological adaptation. In this study, molecular genetic markers based on multiple gene sequences were used to assess genetic diversity and to infer phylogenetic relationships for a group of cytologically highly diverse black flies of the Simulium tuberosum species group in Thailand. Ecological affinities of the species were also investigated. High levels of genetic diversity were found in cytological species complexes, S. tani and S. doipuiense, and also in S. rufibasis, which was cytologically nearly monomorphic. The results highlight the necessity of integrating multilevel markers for fully understanding black fly biodiversity. Phylogenetic relationships based on multiple gene sequences were consistent with an existing dendrogram inferred from cytological and morphological data. Simulium tani is the most distinctive taxa among the members of the S. tubersosum species group in Thailand based on its divergent morphological characters. Molecular data supported the monophyletic status of S. tani, S. weji, and S. yuphae, but S. doipuiense and S. rufibasis were polyphyletic, most likely due to incomplete lineage sorting and inadequate phylogenetic signals. Ecological analyses revealed that members of the S. tuberosum species group have clearly different ecological niches. The results thus supported previous views of the importance of ecology in black fly evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».