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Enregistrement W2316259484 · doi:10.1158/1538-7445.am10-lb-271

Abstract LB-271: The biological role of the transcription factor Kaiso in breast tumorigenesis

2010· article· en· W2316259484 sur OpenAlexaff
Sonali Weerawardane, Juliet M. Daniel

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayCarcinogenesisCancer researchBiologyCell biologyEpithelial–mesenchymal transitionTranscription factorSignal transductionCancerMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: The canonical Wnt signalling pathway regulates various cellular processes (e.g. proliferation, differentiation, apoptosis) and leads to tumorigenesis when aberrantly activated. -catenin, the key downstream effector in Wnt signalling, translocates to the nucleus upon Wnt pathway activation, and activates target genes involved in tumorigenesis. The transcription factor Kaiso is a novel BTB/POZ (Broad complex, Tramtrak, Bric à brac/Pox virus and zinc finger) zinc finger (POZ-ZF) protein that specifically interacts with the cell adhesion cofactor p120ctn. Recent studies from our lab and others have revealed that Kaiso negatively regulates the canonical Wnt pathway by repressing activation of Wnt/ -catenin target genes. Some studies implicate Kaiso as a tumor suppressor (decreased expression in breast, ovarian and colon tumors), and others implicate Kaiso in tumor initiation (Kaiso-deficient mice are resistant to intestinal cancer). The goal of this study is to elucidate the biological role of Kaiso in breast tumorigenesis using various cellular assays. Methods: To assess Kaiso's role in breast cancer, Kaiso was misexpressed in MCF7 (human breast adenocarcinoma) cell lines. Stable Kaiso overexpressing and depleted cell lines were generated and assessed for cell proliferation and cell migration using focus formation, wound healing and matrigel invasion assays. Western blot analysis was performed to assess the effects of Kaiso misexpression on p120 and E-cadherin as well as epithelial-mesenchymal transition markers such as N-cadherin, Snail, Twist and Vimentin. The subcellular localization of Kaiso and its putative target genes in vivo was examined using immunohistochemistry (IHC) analysis of matched pairs of human normal and tumor breast tissue. Results: Focus formation assays revealed increased transformation by cells over-expressing Kaiso, suggesting an oncogenic role for Kaiso in cell culture. Preliminary wound healing and matrigel assays show increased cell motility and migration respectively in Kaiso over-expressing cells compared to parental control cells, thereby suggesting a role for Kaiso in the epithelial-mesenchymal transition. IHC analysis revealed predominant nuclear Kaiso expression in lobular and ductal breast carcinomas in breast tissues. These data support Kaiso's potential role as an oncogene in human breast cancer. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr LB-271.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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