Abstract 1505: The role of cathepsin B in colorectal tumorigenesis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Many cancers express elevated protease levels which contribute to certain aspects of tumor behavior such as growth and metastatic spread. Specifically, elevation of the cysteine protease cathepsin B has been shown to correlate with malignant progression of tumors. The majority of reports on cathepsin B expression in tumors have focused on measurements of activity or protein staining. However, multiple transcripts species have been detected resulting from alternative splicing in the 5’- or 3-untranslated regions, and possibly the use of alternative promoter regions. The specific role of these variants remains to be established. Methods: Expression of cathepsin B was analyzed in normal human intestinal epithelial cells (HIEC) and colorectal cancer cell lines (Caco-2/15, HCT116, DLD1, HT29, SW480, T84, Colo205) by qPCR and Western blot. The role of cathepsin B was examined in HT29 and DLD1 cell lines through recombinant lentiviruses encoding anti-cathepsin B short hairpin RNA (shRNA). Results: RT-PCR analyses demonstrated that the levels of the full transcript for cathepsin B containing exons 1-12 (CB) were similar between normal and cancerous cell lines. By contrast, the splice variant lacking exons 2 and 3 (CB-2,3) was expressed only in cancer cells and in biopsies from human colorectal tumors when compared to the adjacent healthy tissues. Immunofluorescence studies showed that this novel tumor form of cathepsin B (CB-2,3) was associated with nuclei and mitrochondria while the full-length cathepsin B protein (CB) was found in the lysosomes. Western blot analyses on culture media showed a strong secretion of various cathepsin B isoforms by cancer cell lines. The lentiviral infection of a shRNA which specifically knocked-down cathepsin B expression, while decreasing enzyme activity in cell lysates, did not influence colorectal cancer cell proliferation under anchorage-dependent conditions. By contrast, decrease of cathepsin B expression in HT29 and DLD1 colon cancer cell lines resulted in a marked reduction of their capacity to grow in soft agar. Levels of β-catenin protein and phosphorylated ERK1/2 were not affected following cathepsin B silencing in contrast to phosphorylated Akt which was significantly reduced. Further, migration and invasion through Matrigel was reduced by 60% in cells expressing the shRNA against cathepsin B compared to cells expressing a control shRNA. Conclusion: These results suggest that the alternative splicing of cathepsin B could contribute to the aberrant intracellular trafficking and function of cathepsin B in colorectal cancer. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 1505. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-1505
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».