Design and characterization of a novel human Granzyme B inhibitor
Notice bibliographique
Résumé
The intracellular roles of Granzyme B (GrB) in immune-mediated cell killing have been extensively studied. Recent data also implicate GrB in extracellular pathways of inflammation, cytokine activation and autoimmunity. Targeting (GrB) provides a new pharmaceutical agent for various inflammatory disorders. Serpina3n is a mouse extracellular inhibitor of GrB. There is no apparent equivalent in humans. In this study, we used a novel applied genetics approach to engineer a new extracellular GrB serpin. A chimeric protein was generated in which the reactive center loop (RCL) of human extracellular antichymotrypsin (ACT) was replaced with that of serpina3n. This serpin contained 27 amino acid residues from the serpina3n RCL and the remaining 395 residues from human ACT. The insertion converted human ACT into a GrB-inhibitory serpin. Several critical residues were identified by scanning mutagenesis on the chimera and serpina3n. Targeted mutagenesis was conducted on wild-type human ACT by specifically substituting those critical residues, creating a novel inhibitor that contains 99.3% human ACT sequence with only three point mutations. Wild-type human ACT had a kass for GrB of 2.26 × 10(4) M(-1) s(-1), whereas the novel inhibitor binds GrB with a kass of 7.65 × 10(5) M(-1) s(-1). This new drug candidate can be developed in animal models and further tested in clinical trials to help us understand the role of GrB in numerous disorders.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».