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Enregistrement W2317549718 · doi:10.1093/protein/gzu052

Design and characterization of a novel human Granzyme B inhibitor

2014· article· en· W2317549718 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProtein Engineering Design and Selection · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSerpinGranzyme BExtracellularMutagenesisWild typeBiologyGranzymeImmune systemMutantCell biologyGeneticsT cellPerforinGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The intracellular roles of Granzyme B (GrB) in immune-mediated cell killing have been extensively studied. Recent data also implicate GrB in extracellular pathways of inflammation, cytokine activation and autoimmunity. Targeting (GrB) provides a new pharmaceutical agent for various inflammatory disorders. Serpina3n is a mouse extracellular inhibitor of GrB. There is no apparent equivalent in humans. In this study, we used a novel applied genetics approach to engineer a new extracellular GrB serpin. A chimeric protein was generated in which the reactive center loop (RCL) of human extracellular antichymotrypsin (ACT) was replaced with that of serpina3n. This serpin contained 27 amino acid residues from the serpina3n RCL and the remaining 395 residues from human ACT. The insertion converted human ACT into a GrB-inhibitory serpin. Several critical residues were identified by scanning mutagenesis on the chimera and serpina3n. Targeted mutagenesis was conducted on wild-type human ACT by specifically substituting those critical residues, creating a novel inhibitor that contains 99.3% human ACT sequence with only three point mutations. Wild-type human ACT had a kass for GrB of 2.26 × 10(4) M(-1) s(-1), whereas the novel inhibitor binds GrB with a kass of 7.65 × 10(5) M(-1) s(-1). This new drug candidate can be developed in animal models and further tested in clinical trials to help us understand the role of GrB in numerous disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,573
Score d'incertitude au seuil0,436

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle