MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2317990715 · doi:10.1097/01.mib.0000438932.97145.3c

P-190 Use of a Novel Activation Assay to Detect Increased Flagellin-Reactive CD4+ T cells in Peripheral Blood from Crohnʼs Disease Patients

2013· article· en· W2317990715 sur OpenAlexaffabout
Garcia Rosa, Himmel Megan, Jamie Koenekoop, Seidman Ernest, Levings Megan, Steiner Theodore

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésToxoidFlagellinImmunologyMedicineIL-2 receptorPopulationFlow cytometryAntibodyTetanusCD3T cellImmune systemInternal medicineCD8ReceptorImmunizationVaccination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anti-commensal immune responses are abnormally active in patients with IBD. About half of people with Crohn's disease (CD) produce antibodies to bacterial flagellins. However, previous attempts to demonstrate T cell responses against these flagellins have been largely unsuccessful. We used a newly described dual activation-marker flow cytometric assay to quantify flagellin-reactive CD4+ T cells in patients with CD compared to controls. Consenting patients with CD were recruited from the McGill University Health Center IBC clinic. Clinical data collected included age, sex, disease phenotype, and current treatment. Controls were healthy volunteers without a history of IBD. Whole blood from venipuncture was stimulated with 1 µg/mL of LPS-free flagellin (A4-Fla2 or E. coli H18 FliC) for 48 hour and then stained for flow cytometry. The CD3+CD4+ population within the live cell gate was analyzed for expression of CD25 and CD134 (OX40) and the percentage of double positive cells was recorded. Cells were stimulated with tetanus toxoid or phytohemagglutinin as positive controls. Kruskal-Wallis and Mann-Whitney tests were used to compare % CD25+CD134+ cells between groups. The assay has low background, with unstimulated samples showing very few double positive cells (median 0.07%, IQR 0.118%). Tetanus toxoid stimulation led to double positive cells in about half of tested subjects (median 0.425%, IQR 0.87%). LPS stimulation at up to 10 µg/mL did not produce double positive cells, suggesting that the assay reflects TCR-dependent stimulation rather than nonspecific toll-like receptor effects. This is supported by our observation that responses to E. coli FliC (a strong TLR5 agonist) were undistinguishable from those against a transposon mutant of FliC, 2H3, which lacks TLR5 stimulatory activity. Most healthy controls had no discernible increase in double-positive CD4+ cells after stimulation with Fla2 (median 0.08%, IQR 0.32%) or FliC (median 0.11%, IQR 0.431%). In contrast, CD patients had significantly higher percentages of double positive cells after stimulation with Fla2 (median 0.24, IQR .505; P = 0.002) and FliC (median 0.30, IQR 0.53; P = 0.004). Elevated double positive cells were seen in patients with isolated luminal disease (Fla2: P = 0.010; FliC: P = 0.012) as well as those with complicated stricturing/perforating disease, in whom anti-flagellin antibodies are reported to be more prevalent (Fla2: P = 0.046; FliC: P = 0.016). Differences between these 2 groups were not significant. The type of current treatment (5-ASA, immunomodulator, or anti-TNF) also did not significantly affect the percentage of double-positive cells after flagellin stimulation. We used a highly sensitive and specific assay for CD4+ T cell activation to demonstrate for the first time a statistically significant increase in anti-flagellin T cell responses in patients with CD. Responses were similarly directed against E. coli FliC and the A4-Fla2 flagellins, unlike antibody responses, which more strongly target the Fla2-like Clostridiales flagellins. Since helper T cells are important both in optimal production of antibodies and cytotoxic T cell responses, we hypothesize that flagellin-reactive CD4+ cells play a pathogenic role in CD. Future studies will be needed to examine the phenotype of these double-positive cells and their prevalence in intestinal tissue and draining lymph nodes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInflammatory Bowel DiseasesMême sujetInflammatory Bowel DiseaseTravaux en français237 207