Conformation/Tautomerization effect on the pK<sub>a</sub> values of lumazine and 6‐thienyllumazine
Notice bibliographique
Résumé
Density functional theory [B3LYP/6‐311+G(d,p)] was used in combination with the conductor‐like polarizable continuum model (CPCM) solvation model to investigate the relative stability and site‐specific values of neutral and ionized tautomers of lumazine (LM) and 6‐thienylLM (TLM). Two types of populations should be taken into consideration when calculating the , tautomers, and conformers. The major tautomer of neutral LM in aqueous solution is 13‐LM (the 13 notation refers to the acidic protons being in positions 1 and 3 of LM) TLM has decreased acidity at N8 relative to LM. Further, the trans conformer of TLM is more acidic than cis. Similar to the case of LM, for TLM, N1 is more acidic than N3 in the uracil part. However, N8 is predicted to be a stronger acid than N1 for TLM. This acidity enhancement is essentially because of a specific stabilization of the anion when the thienyl group replaces H. Two factors are responsible for the acidity strength of N8: The thienyl ring upon deprotonation acts inductively as an electron‐withdrawing group, and the excess electron density is dispersed better when the system is trans and contains second‐row atoms. Accurate pKa calculation requires that all conformers/tautomers be included into the calculation. Copyright © 2014 John Wiley & Sons, Ltd.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».