Lipid Selectivity, Orientation, and Extent of Membrane Binding of Nonacylated RP2
Notice bibliographique
Résumé
Retinitis pigmentosa 2 (RP2) is an ubiquitary protein of 350 residues. The N-terminus of RP2 contains putative sites of myristoylation and palmitoylation. The dually acylated protein is predominantly localized to the plasma membrane. However, clinically occurring substitution mutations of RP2 in photoreceptors lead to the expression of a nonacylated protein, which was shown to be misrouted to intracellular organelles using different cell lines. However, the parameters responsible for the modulation of the membrane binding of nonacylated RP2 (naRP2) are still largely unknown. The maximal insertion pressure of naRP2 has thus been determined after its injection into the subphase underneath monolayers of phospholipids, which are typical of photoreceptor membranes. These data demonstrated that naRP2 shows a preferential binding to saturated phospholipid monolayers. Moreover, polarization modulation infrared reflection absorption spectroscopy has allowed comparison of the secondary structure of this protein in solution and upon binding to phospholipid monolayers. In addition, simulations of these spectra have allowed to determine that the β-helix of naRP2 has an orientation of 60° with respect to the normal, which remains unchanged regardless of the type of phospholipid. Finally, ellipsometric measurements of naRP2 demonstrated that its particular affinity for saturated phospholipids can be explained by its larger extent of insertion in this phospholipid monolayer compared to that in polyunsaturated phospholipid monolayers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».