The Expression Analysis of Hexokinase 1 Gene in the Pumwani Commercial Sex Worker Cohort, Nairobi, Kenya
Notice bibliographique
Résumé
Background: Altered susceptibility to HIV-1 infection has been observed in a commercial sex worker (CSW) cohort in Nairobi, Kenya, where a subset of women are classified as HIV-1 exposed yet seronegative (HESN). A gene expression analysis conducted showed differential regulation of the glycolysis/gluconeogenesis pathway in HESN CSWs. The first and potentially critical regulatory step in glucose metabolism is its entry into lymphocytes, where glucose binds to Hexokinase-1 that prevents it from leaking out. Together with the Glucose Transporter 1, Hexokinase-1 regulates the first rate-limiting steps of the entire glucose metabolism by phosphorylating glucose into glucose-6-phosphate, which is the starting material for glycolysis. \n \nMethods: The study population was randomly selected from the Pumwani Sex Worker Cohort, Nairobi including: HIV highly exposed yet seronegative (HESNs) CSWs (>7 years); newly enrolled HIV-uninfected (<3 years) CSWs, 85% of whom would likely seroconvert to HIV-1 positive; and lowly-exposed HIV negative antenatal clinic attendees with low exposure to HIV. Total RNA was extracted from PBMCs using Trizol; cellular Hexokinase-1 mRNA levels were quantified by quantitative real time PCR using SYBR Green. Statistical analysis was performed using Mann-Whitney U Test. Differences were considered to be significant if P<0.05. Each assay was normalized using 18s rRNA gene. \n \nResults: We observed significantly lower level of Hexokinase-1 mRNA expression in HESNs when compared to that in newly enrolled HIV uninfected CSWs (Hexokinase-1 p=0.0323). \n \nFurthermore, the levels of Hexokinase-1 mRNA in HESN and the HIV negative antenatal clinic attendees were quite similar (Hexokinase-1 p=0.6448). \n \nConclusions: Lower expression of Hexokinase-1 in HESN might suggest lower regulation of glucose uptake. Hexokinase is a rate-limiting enzyme in the glycolysis pathway. Following studies of expression and uptake are underway to understand its role in glucose metabolism in HIV resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».