MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2320021935 · doi:10.2741/3801

Biological properties of the PrP-like Shadoo protein

2010· review· en· W2320021935 sur OpenAlexafffund
Nathalie Daude

Notice bibliographique

RevueFrontiers in bioscience · 2010
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésPRNPScrapiePrion proteinTandem repeatAlleleBiologyGeneGlycoproteinGeneticsDiseaseMedicineGenomePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The SPRN gene encodes the Shadoo glycoprotein (Sho), a central nervous system-expressed member of the prion protein superfamily. Sho has similarity to two features within PrPC's natively unstructured N-terminus, a hydrophobic domain and tandem repeats with positively charged residues. Indeed, scrutiny of Sho's biochemical properties in uninfected cells has revealed overlaps with the properties of PrPC, these including shared protein binding partners. SPRN is conserved in mammals, as is the prion gene PRNP, but in sheep SPRN and PRNP are both marked by polymorphic variation, suggestive of a shared selection pressure within these scrapie disease-prone livestock animals. In rodent models of prion disease there are reduced levels of Sho in infected tissues, defining a form of cross-regulation between full-length Sho holoprotein and PrPSc. In human prion disease an SPRN signal peptide polymorphism is associated with risk for sporadic Creutzfeldt-Jakob Disease (CJD), while two patients with early-onset variant CJD carried putatively inactive SPRN alleles. Further investigation of Sho as a novel tracer or modifier for the accumulation of pathologic forms of PrP may prove advantageous.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in bioscienceMême sujetPrion Diseases and Protein MisfoldingTravaux en français237 207