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Enregistrement W2320575024 · doi:10.1111/j.1755-0998.2012.03133.x

Permanent Genetic Resources added to Molecular Ecology Resources Database 1 December 2011 – 31 January 2012

2012· article· en· W2320575024 sur OpenAlexaff
Maria Cristina Arias, Emilie Arnoux, James J. Bell, Abel Bernadou, GIORGIA BINO, Rumsaïs Blatrix, Denis Bourguet, Cecilia Carrea, Anne‐Laure Clamens, Haydée A. Cunha, Emmanuelle d’Alençon, Yi Ding, Champlain Djiéto-Lordon, M.P. Dubois, Pascal Dumas, Cyril Éraud, Bruno Faivre, Flávio de Oliveira Francisco, Elaine Françoso, Maria Elena García, Jonathan P. A. Gardner, Stéphane Garnier, Sylvie Gimenez, John R. Gold, D. James Harris, Guangcun He, Bart Hellemans, Christopher M. Hollenbeck, Shengli Jing, Gaël J. Kergoat, Bingfang Liu, Jan R. McDowell, Doyle McKey, Terrence L. Miller, Erica J. Newton, Katrina M. Pagenkopp Lohan, Chiara Papetti, Ian G. Paterson, Jean Peccoud, Xinxin Peng, Finn Piatscheck, Sergine Ponsard, Kimberly S. Reece, Céline Reisser, Mark A. Renshaw, Daniel E. Ruzzante, Mathieu Sauve, Jeffrey D. Shields, Antônio M. Solé‐Cava, Erika Souche, J. K. J. VAN HOUDT, Filip Volckaert, Shuzhen Wang, Jie Xiao, Hangjin Yu, Lorenzo Zane, BARBARA ZANNATO, Tyler Zemlak, Chunxiao Zhang, Yan Zhao, Xi Zhou, Lili Zhu

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology Resources · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFreshwater macroinvertebrate diversity and ecology
Établissements canadiensTrent UniversityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyZoologySciaenidaeMicrosatelliteFisheryEcologyGeneticsFish <Actinopterygii>Gene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This article documents the addition of 473 microsatellite marker loci and 71 pairs of single-nucleotide polymorphism (SNP) sequencing primers to the Molecular Ecology Resources Database. Loci were developed for the following species: Barteria fistulosa, Bombus morio, Galaxias platei, Hematodinium perezi, Macrocentrus cingulum Brischke (a.k.a. M. abdominalis Fab., M. grandii Goidanich or M. gifuensis Ashmead), Micropogonias furnieri, Nerita melanotragus, Nilaparvata lugens Stål, Sciaenops ocellatus, Scomber scombrus, Spodoptera frugiperda and Turdus lherminieri. These loci were cross-tested on the following species: Barteria dewevrei, Barteria nigritana, Barteria solida, Cynoscion acoupa, Cynoscion jamaicensis, Cynoscion leiarchus, Cynoscion nebulosus, Cynoscion striatus, Cynoscion virescens, Macrodon ancylodon, Menticirrhus americanus, Nilaparvata muiri and Umbrina canosai. This article also documents the addition of 116 sequencing primer pairs for Dicentrarchus labrax.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,331
Score d'incertitude au seuil0,954

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0060,008
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3310,281

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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