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Enregistrement W2321022453 · doi:10.1021/jp1067022

Molecular Dynamics Simulation Study of Water Surfaces: Comparison of Flexible Water Models

2010· article· en· W2321022453 sur OpenAlexaff
Pak K. Yuet, Daniel Blankschtein

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2010
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueSpectroscopy and Quantum Chemical Studies
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular dynamicsWater modelSurface tensionIntermolecular forceHydrogen bondIntramolecular forceFlexibility (engineering)ChemistryMoleculeChemical physicsMaterials scienceThermodynamicsComputational chemistryPhysicsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecular dynamics (MD) simulation has been used extensively to study water surfaces. Nevertheless, the quantitative prediction of water surface tension has been controversial, since results from different simulation studies using the same water model may differ considerably. Recent research has suggested that bond flexibility, long-range electrostatic interactions, and certain simulation parameters, such as Lennard-Jones (LJ) cutoff distance and simulation time, may play an important role in determining the simulated surface tension. To gain better insight on the MD simulation of water surfaces, particularly on the prediction of surface tension, we examined seven flexible water models using a consistent set of simulation parameters. The surface tensions of the flexible, extended simple point charge (SPCE-F) model and the flexible three-center (F3C) model at 300 K were found to be 70.2 and 65.3 mN/m, respectively, in reasonable agreement with the experimental value of 71.7 mN/m. More importantly, however, detailed analysis of the interfacial structure and contributions from various interactions have revealed that the surface tension of water is determined by the delicate balance between intramolecular (bond stretching) and intermolecular (LJ) interactions, which reflects both the molecular orientation in the interfacial region and the density variation across the Gibbs dividing surface (GDS). In addition, the water molecules on the liquid side of the GDS were found to lie almost parallel to the surface, which helps to clarify the dual-layer structure suggested by sum-frequency generation spectroscopy. By correlating the simulated surface tensions of the seven water models with selected molecular parameters, it was found that the partial charge distribution in the water molecule is likely a key factor in determining the near-parallel alignment of water molecules with the surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations152
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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