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Enregistrement W2321118242 · doi:10.1093/neuonc/nou206.51

SINGLE CELL DERIVED CLONAL ANALYSIS OF HUMAN GLIOBLASTOMA LINKS FUNCTIONAL AND GENOMIC HETEROGENEITY

2014· article· en· W2321118242 sur OpenAlex
Peter B. Dirks, M D Meyer, Jüri Reimand, Xiaoyang Lan, Renee Head, Xiaoping Zhu, Michelle Kushida, Jane Bayani, Jessica C. Pressey, Anath C. Lionel, Ian D. Clarke, Michael D. Cusimano, Jeremy A. Squire, Stephen W. Scherer, Mark Bernstein, Melanie A. Woodin, Gary D. Bader

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTemozolomideclone (Java method)BiologyAutocrine signallingCancer researchParacrine signallingGlioblastomaGeneticsGeneSomatic evolution in cancerDrug resistanceComputational biologyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Glioblastoma (GBM) is a cancer comprised of morphologically, genetically and phenotypically diverse cells. However, an understanding of the functional significance of intratumoral heterogeneity is lacking. METHODS: We devised a method to isolate and functionally profile tumorigenic clones from patient glioblastoma samples. RESULTS: Individual clones demonstrated unique proliferation and differentiation abilities. Importantly, naïve patient tumors included clones that were temozolomide (TMZ) resistant, indicating that resistance to conventional GBM therapy preexists in untreated tumors at a clonal level. Further, candidate therapies for resistant clones were identified with clone-specific drug screening. Genomic analyses identified genes and pathways that associate with specific functional behavior of single clones. In particular, increased expression and signaling of the autocrine/paracrine γ-aminobutyric acid (GABA) receptor GABRA3 correlates with TMZ sensitivity and patient outcome. CONCLUSIONS: Our results suggest that functional clonal profiling used to identify tumorigenic and drug resistant tumor clones will lead to the discovery of new GBM clone-specific treatment strategies. SECONDARY CATEGORY: n/a.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,405
Score d'incertitude au seuil0,513

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle