Epigenetic Silencing of the<i>HIC-1</i>Gene in Human Medulloblastomas
Notice bibliographique
Résumé
The HIC-1 (hypermethylated in cancer) candidate tumor suppressor gene is located on chromosome 17p13.3, a region frequently deleted in medulloblastomas (MBs). MBs arising in the cerebellum represent the most common malignant brain tumors in children. In this study we have analyzed the sequence, methylation, and expression status of the HIC-1 gene in MBs. Hypermethylation of the 5'UTR and/or second exon of HIC-1 was detected in 33/39 (85%) of MB biopsies and in 7/8 (88%) of MB cell lines by methylation-specific PCR. There was a significant correlation (p < 0.001) between HIC-1 methylation and lack of transcription as determined by competitive RT-PCR. Treatment of the MB cell lines Daoy and MEB-MED-8A with 5-aza-2'deoxycytidine led to re-expression of HIC-1 transcripts, indicating a silencing of HIC-1 by CpG island methylation. Mutation analysis of the coding region of HIC-1 revealed a single deletion leading to an in-frame deletion of 4 amino acids in the second exon of HIC-1 (1/68, 1.5%). Our data indicate that a significant number of MBs exhibit strikingly reduced HIC-1 expression caused by altered CpG island methylation. These data suggest that epigenetic silencing of HIC-1 may well contribute to the pathogenesis in the majority of MBs.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».