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Enregistrement W2321755216 · doi:10.1021/jp306420e

Gas-Phase Structures of Pb<sup>2+</sup>-Cationized Phenylalanine and Glutamic Acid Determined by Infrared Multiple Photon Dissociation Spectroscopy and Computational Chemistry

2012· article· en· W2321755216 sur OpenAlexaff
Michael Burt, Travis D. Fridgen

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInfrared multiphoton dissociationChemistryDeprotonationDissociation (chemistry)Infrared spectroscopySpectroscopyInfraredCrystallographyPhysical chemistryOrganic chemistryIon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infrared multiple photon dissociation (IRMPD) spectroscopy in the 3200-3800 cm(-1) region was used to determine the gas-phase structures of bare and monohydrated [Pb(Phe-H)](+) and [Pb(Glu-H)](+). These experiments were supported by infrared spectra calculated at the B3LYP/6-31+G(d,p) level of theory as well as 298 K enthalpies and Gibbs energies determined using the MP2(full)/6-311++G(2d,2p)//B3LYP/6-31+G(d,p) method. The gas-phase structure of [Pb(Phe-H)](+) has Pb(2+) bound in a tridentate fashion between Phe's amine nitrogen, one oxygen of the deprotonated carboxyl group, and the aromatic ring. The IRMPD spectrum of [Pb(Glu-H)](+) can be assigned to a structure where the side chain carboxyl group is deprotonated. The structure of [Pb(Phe-H)H(2)O](+) is simply the hydrated analogue of [Pb(Phe-H)](+) where water attaches to Pb(2+) in the same hemisphere as the ligated amino acid. The spectrum of [Pb(Glu-H)H(2)O](+) could not be assigned a unique structure. The IRMPD spectrum shows features attributed to symmetric and antisymmetric O-H stretching of water and a broad band characteristic of a hydrogen bonded O-H stretching vibration. These features can only be explained by the presence of at least two isomers and agree with the computational results that predict the four lowest energy structures to be within 6 kJ mol(-1) of one another.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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