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Enregistrement W2322194776 · doi:10.1016/j.juro.2016.02.2196

MP83-14 GENOMIC EXPRESSION EVIDENCE FOR ANDROGEN RECEPTOR AXIS ACTIVATION IN UROTHELIAL CARCINOMA: DATA FROM THE CANCER GENOME ATLAS

2016· article· en· W2322194776 sur OpenAlexaff
Edwin E. Morales, Stephen B. Williams, Goodwin G. Jinesh, Debasish Sundi, C. Smith, David J. McConkey, Ashish M. Kamat

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Urology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAndrogen receptorCarcinogenesisBladder cancerAndrogenMedicineDihydrotestosteroneCancer researchCancerOncologyInternal medicineProstate cancerHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

You have accessJournal of UrologyBladder Cancer: Basic Research & Pathophysiology IV1 Apr 2016MP83-14 GENOMIC EXPRESSION EVIDENCE FOR ANDROGEN RECEPTOR AXIS ACTIVATION IN UROTHELIAL CARCINOMA: DATA FROM THE CANCER GENOME ATLAS Edwin E. Morales, Stephen B. Williams, Jinesh G. Goodwin, Debasish Sundi, Carolyn L. Smith, David J. McConkey, and Ashish M. Kamat Edwin E. MoralesEdwin E. Morales More articles by this author , Stephen B. WilliamsStephen B. Williams More articles by this author , Jinesh G. GoodwinJinesh G. Goodwin More articles by this author , Debasish SundiDebasish Sundi More articles by this author , Carolyn L. SmithCarolyn L. Smith More articles by this author , David J. McConkeyDavid J. McConkey More articles by this author , and Ashish M. KamatAshish M. Kamat More articles by this author View All Author Informationhttps://doi.org/10.1016/j.juro.2016.02.2196AboutPDF ToolsAdd to favoritesDownload CitationsTrack CitationsPermissionsReprints ShareFacebookTwitterLinked InEmail INTRODUCTION AND OBJECTIVES Recent investigations have implicated the androgen receptor in the oncogenesis and progression of urothelial carcinoma. Current evidence exists that inhibition of dihydrotestosterone (DHT) production decreases the risk of bladder cancer by nearly a third in a large North American cancer screening cohort. The precise biological mechanism of DHT inhibition and reduced bladder carcinogenesis remains to be elucidated. We sought to analyze the bladder database of the Cancer Genome Atlas (TCGA) for androgen gene signature enrichment, and for expression of downstream target genes of the androgen receptor using heat mapping and genome set enrichment analysis. METHODS The TCGA is a multicenter study that examined 11,000 patient tumors as well as normal tissues to generate a genetic atlas of 33 distinct cancer types. The bladder TCGA was queried for expression of androgen axis gene expression signatures using GENE-E software (Broad Institute, Cambridge MA). Using this data, gene expression patterns were analyzed and using hierarchical clustering, matched to existing TCGA basal and luminal tumor subtypes. RESULTS Expression of the 5-alpha reductase isozymes SRD5A1, 2, and 3 (the inhibitory target of finasteride) was confirmed using the 128 tumor TCGA database and clustered into basal and luminal TCGA subtypes, with Clusters 1 and 2 (luminal or “epithelial-like”) expressing SRD5A2 and 3 while basal and “p-53 like” tumors expressed the more typical prostatic SRD5A1. In addition, significant expression of steroidal pathway synthesis and androgen/estrogen axes genes were observed, again clustered by TCGA subtype. Validation of these preliminary findings are underway. CONCLUSIONS Gene expression data suggest that urothelial cancer of the bladder exhibits activation of androgen synthesis and androgen receptor cross-talk pathways along with expression of the enzyme 5-alpha reductase. Expression appears to segregate by TCGA subtype which may be important in future clinical trials for subtype-specific antitumor therapies. © 2016FiguresReferencesRelatedDetails Volume 195Issue 4SApril 2016Page: e1086 Advertisement Copyright & Permissions© 2016MetricsAuthor Information Edwin E. Morales More articles by this author Stephen B. Williams More articles by this author Jinesh G. Goodwin More articles by this author Debasish Sundi More articles by this author Carolyn L. Smith More articles by this author David J. McConkey More articles by this author Ashish M. Kamat More articles by this author Expand All Advertisement Advertisement PDF downloadLoading ...

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Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,124

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,008
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0370,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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